Cơ cấu tổ chức
Trường được tổ chức với mô hình ban giám hiệu điều hành và quản lý chung với hiệu trưởng là bà Nguyễn Thị Thanh và các phó hiệu trưởng là bà Phùng Thị Ngọc Hà, ông Nguyễn Quang Bạ và ông Đỗ Văn Lợi. Công tác giáo dục được phân chia thành 8 tổ bộ môn: Toán, Lý - Tin - Kỹ thuật công nghiệp, Hóa, Sinh, Văn, Sử - Địa - GDCD, Ngoại ngữ, Thể dục. Ngoài ra còn các phòng ban thực hiện công tác phục vụ vận hành trường gồm: Văn thư, Thí nghiệm, Thư viện, Bảo vệ, Quản trị, Lao công và Y tế. Thi tuyển
Học sinh tốt nghiệp lớp 9 muốn vào học tại trường phải tham gia kì thi tuyển sinh vào lớp 10 chung cho các trường THPT chuyên và không chuyên trực thuộc Sở Giáo dục và Đào tạo Hà Nội. Trên địa bàn Hà Nội (sau khi mở rộng tháng 8/2009), đây là một trong số bảy trường THPT có kì thi tuyển đầu vào, các trường còn lại là Hệ THPT chuyên của Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội, Trường THPT chuyên, Đại học Sư phạm Hà Nội, Trường THPT Chuyên ngữ, Đại học Quốc gia Hà Nội, Trường THPT chuyên Hà Nội - Amsterdam, Trường THPT Chu Văn An và Trường THPT chuyên Nguyễn Huệ. Các thí sinh đăng kí thi vào hệ THPT chuyên phải thi bốn môn bắt buộc là Toán, Văn, Tiếng Anh điều kiện và môn chuyên tương ứng: lớp chuyên Toán - Tin là môn Toán, chuyên Văn là môn Văn, chuyên Sử là môn Sử,chuyên Địa là môn Địa lý, chuyên Anh là môn tiếng Anh, chuyên Lý là môn Lý , chuyên Hóa là môn Hóa, chuyên Sinh là môn Sinh. Điểm xét tuyển sẽ là tổng điểm ba môn Toán, Văn, Ngoại Ngữ (mỗi môn lấy hệ số 1) cộng với điểm môn chuyên nhân đôi (hệ số 2), thí sinh lấy từ cao xuống thấp đến hết chỉ tiêu của lớp chuyên. Các thí sinh chỉ đăng kí xét tuyển vào các lớp phổ thông sẽ thi hai môn Toán Văn và lấy điểm xét tuyển là tổng điểm hai môn này. Thí sinh dự thi vào trường THPT Sơn Tây đều phải có hộ khẩu Hà Nội. Hệ thống lớp học
Tính cho đến niên khóa 2007 - 2010, Trường THPT Sơn Tây có khoảng gần 2000 học sinh thuộc ba khối 10, 11 và 12. Hệ thống lớp học của trường THPT Sơn tây bao gồm 9 lớp chuyên: Toán, Lí, Hóa, Sinh, Tin, Văn, Sử, Địa, Tiếng Anh và một số lớp phổ thông tùy thuộc vào chỉ tiêu tuyển sinh mỗi năm, thông thường là sẽ có thêm một lớp pháp 12 năm và một lớp pháp 3 năm. Kết quả đào tạo
Tỷ lệ đỗ tốt nghiệp của trường luôn là xấp xỉ 100%, số học sinh giỏi cấp tỉnh và thành phố khoảng 1300 học sinh, số học sinh đỗ đại học khoảng 10000 học sinh, có 24 học sinh quốc gia và 2 học sinh đạt huy chương bạc giọng hát hay toàn quốc. Trong các năm gần đầy trường luôn có mặt trong top 200 trường phổ thông tốt nhất Việt Nam và đặc biệt là trong năm học 2010 này, trường đứng thứ 102 toàn quốc về điểm trung bình thi đai học .
