國立臺灣大學生化科學研究所

💫生化所研究成果發表

先進甲基核磁共振技術揭示癌症突變如何破壞腫瘤抑制蛋白 BAP1 的異位調控網絡

中央研究院生物化學研究所徐尚德研究員所領導的研究團隊，利用先進甲基核磁共振（methyl NMR）光譜技術、蛋白質動態分析與分子模擬，成功解析重要腫瘤抑制蛋白 BRCA1-associated protein 1（BAP1）中的遠距異位調控網絡，並系統性闡明近五十個癌症相關突變如何擾亂其酵素功能。

BAP1 是一種與間皮瘤、葡萄膜黑色素瘤及腎細胞癌等多種癌症相關的重要去泛素化酶（deubiquitinase）。其催化核心 UCH 結構域具有罕見的「5₂ Gordian knot」深度拓撲扭結構型。研究團隊透過一系列點突變之甲基核磁共振化學位移擾動資訊，重建存在於 BAP1 打結疏水核心中的異位調控網絡，並且透過CPMG弛豫色散（relaxation dispersion）動態量測，以及微秒尺度全原子分子動力學模擬洞悉BAP1 內部存在以L49 與周遭芳香族氨基酸支鏈作為動態交互作用樞紐，可協調遠距離區域間的訊息傳遞與酵素活性調控。

研究中特別指出，一旦L49因為癌症突變失去一個碳原子的側鏈長度，便打斷蛋白質內部長距離動態耦合與去泛素化酶活性。一系列臨床癌症突變也都存在於這個異位調控網絡，牽一髮動全身，可以透過遠距離的細微變異造成功能和蛋白質穩定性的破壞。本研究系統性分析BAP1癌症相關突變，建立目前全球針對BAP1相關疾病最大規模的分子層面實驗性結構—功能關聯資料庫，為理解 BAP1 癌症致病機制提供重要分子基礎，也突顯先進核磁共振技術在解析蛋白質動態與異位調控上的獨特優勢。

本研究由中央研究院與國家科學及技術委員會提供經費支持，第一作者賴治暄博士也由國家科學及技術委員會資助。並由中央研究院高磁場核磁共振核心設施、生物物理核心設施
生物化學研究所生物物理核心以及國家同步輻射研究中心小角X光散射實驗站提供技術支援。研究成果已發表於《自然通訊》（Nature Communications）。

論文名稱：Allosteric network of dynamic coupling within BAP1-UCH revealed by methyl NMR

作者群：賴治暄、羅元超、張七鳳、盧韋霖、庫瑪、 #王永勝、 #吳昆峯、Carlo Camilloni 、 #徐尚德

論文全文：
https://doi.org/10.1038/s41467-026-73600-4

徐尚德實驗室：
https://www.ibc.sinica.edu.tw/Faculty/ViewPI?DatetimeStr=20210916145602

中央研究院高磁場核磁共振中心
https://www.nmr.sinica.edu.tw/en/

中央研究院生物物理核心設施：
https://bcf.daais.sinica.edu.tw

國家同步輻射研究中心小角X光散射實驗站：
https://tpsbl.nsrrc.org.tw/bd_page.aspx?lang=en&port=13A&pid=1069

114學年度生科院壁報比賽，
得獎名單將在5/30(六)畢典當天頒獎!!讓我們期待誰能獲獎~~

【徵才訊息】派駐工研院-食藥署研究助理

職缺描述
(一) 協助辦理第二、三等級體外診斷醫療器材查驗登記相關業務。
(二) 協助辦理第一等級醫療器材查驗登記相關業務。
(三) 協助辦理專案製造及專案輸入相關業務。
(四) 其他交辦事項。

科系要求
生醫工程學類、生命科學學門、醫藥衛生學門

其他條件要求請自行進入連結~

www.1111.com.tw

兩年前，白頭翁悄悄在所上中庭的聖誕樹上築巢，為忙碌的校園生活帶來一份意外而溫暖的驚喜。

今年，牠們又回來了，而且還迎來了三隻雛鳥誕生。看著小小的身影在巢中探出頭、等待親鳥餵食，讓忙碌的日常多了一份生氣，也多了一份期待。

今天三隻白頭翁雛鳥已經陸續飛離鳥巢，開始在周邊地面停留、活動。由於牠們仍在學習飛行，短時間內可能會停駐在走廊上或建物周圍，親鳥也會在附近持續照顧與餵食。請大家經過時多留意腳步，放慢步伐，避免不小心踩到牠們，讓牠們能在自然環境中安心適應與成長。

謝謝大家一起守護這份來自校園的小小生命力。

能夠再次見證這份生命的延續，對所上師生而言，是一份特別而珍貴的陪伴。願這群小生命平安長大，也為大家帶來更多溫暖與喜悅。

💫生化所研究成果發表

本研究獲中研院與國科會資助，第一作者為生化所博士班 #翁子文 同學。

熱騰騰出爐的研究成果發表於The Journal of Physical Chemistry B：Pentameric Architecture of the SARS-CoV-2 Envelope Protein Revealed by SEC-MALS, Cryo-EM, and Molecular Dynamics

SARS‑CoV‑2 的包膜（E）蛋白自組裝分子結構曝光

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.5c08730

SARS‑CoV‑2 的包膜（E）蛋白雖然只有 75 個胺基酸，卻在病毒組裝、離子通道活性與病毒–宿主互動中扮演關鍵角色，其完整寡聚結構與在生理膜環境中的動態行為一直備受關注。

本所徐尚德研究團隊利用固相化學合成取得全長 E 蛋白，並藉由分子篩層析結合多角度光散射（SEC‑MALS）與奈米盤重組技術，直接證實 E 蛋白在溶液及膜環境中皆形成單一且穩定的五聚體複合體。

進一步的負染與低溫電子顯微鏡觀察到與五聚體一致的密度分佈。與加拿大渥太華大學李志遠教授團隊合作，透過全原子分子動力學模擬顯示E 蛋白的跨膜螺旋核心高度穩定，其碳端尾部在不同膜環境中展現顯著構形可塑性，會貼附並部分插入脂雙層，造成局部膜厚變薄與非對稱形變。

這項成果不僅填補全長 SARS‑CoV‑2 E 蛋白寡聚架構的關鍵空缺，也為理解冠狀病毒如何透過膜重塑與出芽完成病毒組裝，以及針對 E 蛋白離子通道與膜結合介面設計新型抗病毒策略，提供重要的結構與動力學基礎。

(下圖被選為當期封面)

💫生化所研究成果發表

本研究獲中研院與國科會資助，兩位共同第一作者為生化所碩士班 # #蕭偉成 及 #姜宗昇 同學。

熱騰騰出爐的研究成果又一篇發表於The Journal of Physical Chemistry B：Mass Photometry Reveals Distinct ACE2 Binding Stoichiometries across SARS-CoV-2 Omicron Subvariants

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.6c00027

質量光度技術揭示SARS-CoV-2 Omicron變異株與人類受體結合的演化策略

本所徐尚德研究團隊發現SARS-CoV-2 Omicron變異株與人類ACE2受體結合模式的獨特演化軌跡。運用中研院生物物理核心設施的全臺唯一質量光度（mass photometry）技術(一種僅需奈莫耳級蛋白質的尖端單分子技術),發現不同Omicron亞變異株以不同的結合化學計量與ACE2結合—即同時結合不同數量的ACE2分子。

研究分析從BA.1到JN.1的八個關鍵Omicron亞變異株,顯示非線性演化路徑。早期變異株如BA.4.5和BA.2.75表現出增強的多價結合,BA.4.5有24%的棘蛋白結合兩個ACE2分子、10%結合三個,可能透過親合力效應增強病毒附著能力。然而,近期變異株EG.5.1和JN.1儘管累積更多突變,卻逆轉此趨勢,58%維持未結合ACE2狀態。

值得注意的是,JN.1在受體結合界面附近具有兩個獨特的N-連結糖基化位點(N245和N354),可能在立體結構上阻擋ACE2接近,同時促進免疫逃逸。所有變異株在生物層干涉測量中維持高結合親和力,證明化學計量與親和力是獨立的演化參數。此研究證明病毒演化不僅優化結合親和力,還優化結合化學計量和糖盾結構—揭示了平衡受體結合與抗體逃逸的精密策略。這些發現為理解SARS-CoV-2適應性提供關鍵見解,並可能指導下一代疫苗設計。

🔥 2026年 中研院生化所 x 臺大生化所 大專生暑期實習計畫開跑啦！🔥
想在這個夏天探索最新的生化研究嗎？現在就是你的機會！🙌 即日起至 4 月 30 日，快來報名，一起開啟你的實驗探險之旅吧！🔬✨
資訊及報名網址：
https://w3.ibc.sinica.edu.tw/SummerInternship/

📢【徵才資訊分享】

以下職缺資訊為協助轉知，非本單位職缺，歡迎有興趣者自行申請！

🔹 徵才單位｜ 財團法人醫藥品查驗中心
🔹 職　　稱｜ CMC審查員_學名藥/新藥查驗登記、生物製劑博士級審查員

https://www.cde.org.tw/joincde/1409/1999/13531/?Page=2&PageSize=10

⚠️ 本公告僅協助資訊分享，詳細職缺內容與應徵相關問題，請直接與徵才單位聯繫。