21/09/2026
Ponuka PhD pozicií:
Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV, v. v. i.
Názov témy
Identifikácia úlohy génu SYT3 v ontogenéze rastlín a v reakciách na environmentálne stresy
Program DŠ
fyziológia rastlín
Rok prijímania
2026
Meno školiteľa/-ky
doc. RNDr. Ján Jásik, DrSc.
Kontakt: [email protected]
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Synaptotagminy ako senzory vápnika v neurónoch zvierat sú podrobne študované, ale ich objav v rastlinách bol prekvapujúci. SYT1 v modelovom organizme Arabidopsis thaliana sa podieľa na reakciách na rôzne environmentálne stresy. Úloha ostatných členov tejto rodiny je doteraz málo prebádaná. Téma doktorskej práce sa zameriava na gén SYT3 v modelových organizmoch suchozemských rastlín Arabidopsis thaliana a Physcomitreopsis patens. Gén bude podrobne charakterizovaný pomocou štandardných metód analýzy génovej expresie na rôznych úrovniach (GUS, GFP, qPCR), analýzou dostupných T-DNA inzerčných mutantov a knock-down/out línií vytvorených pomocou homológnej rekombinácie a metód CRISPR/Cas9.
Identification of the role of the SYT3 gene in plant ontogenesis and responses to environmental stresses
PhD. program
plant physiology
Year of admission
2026
Name of the supervisor
doc. RNDr. Ján Jásik, DrSc.
Contact: [email protected]
Receiving school
Faculty of Natural Sciences Comenius University
Annotation
Synaptotagmins, calcium sensors in animal neurons, have been studied in detail, but their discovery in plants was surprising. In the model organism Arabidopsis thaliana, SYT1 is involved in responses to various environmental stresses. The role of other members of this family has been poorly explored so far. The doctoral thesis focuses on the SYT3 gene in the model organisms of terrestrial plants, Arabidopsis thaliana and Physcomitrium patens. The gene will be characterized in detail using standard methods of gene expression analysis at multiple levels, including GUS, GFP, and qPCR; analysis of available T-DNA insertion mutants; and knockdown/out lines generated by homologous recombination and CRISPR/Cas9.
émy doktorandského štúdia
Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV, v. v. i.
Názov témy
Identifikácia molekulárnych markerov pre rôzne fázy diferenciácie adventívnych koreňov
Program DŠ
fyziológia rastlín
Rok prijímania
2026
Meno školiteľa/-ky
doc. RNDr. Ján Jásik, DrSc.
Kontakt: [email protected]
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Nevyhnutným predpokladom množenia rastlín pomocou stonkových odrezkov je tvorba kvalitného systému adventívných koreňov. Adventívne korene sa vyvíjajú de novo z už špecializovaných buniek rôznych orgánov. Tieto bunky sa musia preprogramovať, čo je sprevádzané ich význačnými zmenami na molekulárno biologickej, fyziologickej a morfologickej úrovni. Všeobecným zámerom PhD. témy je prispieť pomocou súčasných molekulárno a bunkovo biologických postupov k poznaniu faktorov, od ktorých závisí optimálna tvorba adventívnych koreňov. Na základe proteomickej a transkriptomickej analýzy budú vytypované kĺučové markerové gény, ktoré sa podieľajú na regulácii jednotlivých fáz tvorby adventívnych koreňov, od preprogramovania už špecializovaných buniek až po prerastanie koreňových primordií. Overí sa platnosť týchto markerov pre byliny a dreviny a bude navrhnuté využitie získaných poznatkov v šľachtiteľskej praxi pre optimalizáciu zakoreňovania hospodársky významných druhov.
opic
Identification of molecular markers for different stages of adventitious root differentiation
PhD. program
plant physiology
Year of admission
2026
Name of the supervisor
doc. RNDr. Ján Jásik, DrSc.
Contact: [email protected]
Receiving school
Faculty of Natural Sciences Comenius University
