Criada devido à necessidade de acolher alunos de vários sítios circundantes da área do Funchal, esta escola começou a funcionar na travessa do Lazareto, no ano 1983 como anexo à Escola de Artes de Francisco Franco (mais conhecida por Escola Secundária Francisco Franco). As primeiras instalações da Escola dos Louros eram do género pré-fabricado. Aí eram ministradas aulas a alunos do 2.º ciclo. Mais tarde, em 1986, a Escola Preparatória dos Louros sofre nova alteração, passando a funcionar como anexo à Escola Bartolomeu Perestrelo. Foi somente no ano de 1989, e devido sobretudo ao crescente aumento de população discente da Escola dos Louros, que a mesma se tornou independente. Ainda durante esse ano, esta escola toma como anexo às suas instalações, a antiga Escola Primária do Faial, situada na Estrada Visconde Cacongo, que passou a ser conhecida por Escola Preparatória do Faial - anexo Louros. Mesmo assim, e como os anos não perdoam, as instalações pertencentes a esta instituição começaram a apresentar indícios de precariedade, tornando-se deficientes e insuficientes para o bom desempenho das funções dos docentes e aprendizagem de seus alunos. Assim, em Outubro de 2000, foram inauguradas as novas instalações, situadas na Rua dos Louros. A partir de então, esta escola lecionou os 2.º e 3.º ciclos de aprendizagem, sendo conhecida como Escola Básica dos 2.º e 3.º Ciclos dos Louros. Por ter uma vasta área, não houve necessidade de continuar a suportar as de um anexo, pelo que a Escola Preparatória do Faial foi dispensada, funcionamento presentemente com escola primária e creche. As antigas instalações da Escola dos Louros foram também ocupadas, acolhendo alunos com deficiências intelectuais que aí aprenderam alguns conhecimentos básicos. No dia 1 de setembro de 2022, a Escola iniciou a integração das comunidades escolares de S. Gonçalo que nos trará maior diversidade e enriquecimento do nosso Projeto Educativo para o quadriénio 2022-2026!
