Od roku 1995/96 liceum zostało przeniesione do budynku przy ulicy Kcyńskiej 1 i od tej pory działa jako samodzielna szkoła. W tym samym roku szkolnym odbył się pierwszy egzamin dojrzałości. Wiosną 2000 roku w szkole powstał teatr "MEANDRY", który od tamtego czasu wystawił 21 przedstawień. Jesteśmy niewielką szkołą, w której obecnie jest 9 oddziałów, do których uczęszcza 222 uczniów. W 2007 roku z okazji 15- lecia istnienia szkoła otrzymała imię Stanisława Wyspiańskiego. Natomiast 4 września 2012 roku odbyła się długo oczekiwana uroczystość otwarcia nowo wybudowanej sali gimnastycznej o powierzchni 456,2 m2. Od początku istnienia liceum jej dyrektorem był Stanisław Głowacki, który po 38 latach pracy zawodowej, w sierpniu 2015 roku przeszedł na emeryturę. Od tego momentu funkcję dyrektora szkoły pełni Elżbieta Kłosowska – Hilscher. 1 kwietnia 2017 roku I Liceum Ogólnokształcące im. Stanisława Wyspiańskiego w Szubinie obchodziło 25-lecie swojego istnienia. Od 2016 roku liceum z sukcesem realizuje międzynarodowe projekty Erasmus+. W latach 2016-2020 zrealizowano łącznie 6 projektów na łączna kwotę 181 tyś. euro. Obecnie liceum jest bardzo nowoczesną szkołą, wszystkie klasy wyposażone są w monitory interaktywne, nauka prowadzona jest także przy wykorzystaniu ipadów i nowoczesnych metod pracy. Szubińskie liceum wykształciło 1552 absolwentów, którzy podjęli dalszą drogę edukacji i dziś pełnią ważne role społeczne i zawodowe.
