Nuñoa, hasta finales del siglo XIX, contaba con una sola Escuela Elemental para varones, exclusivamente para la educación de los principales que en esos tiempos ostentaban los cargos de autoridades y vecinos notables del pueblo como: Caciques, Varayoc, Albaceas y Graneros, nominados por las autoridades virreinales y posteriormente republicanos. Al ver que era necesario otra escuela para la educaci
ón de las niñas, se gestionó la creación e inmediatamente se apertura la Escuela Elemental de Niñas, en la fecha del 24 de mayo de 1 901, siendo en ese entonces Presidente de la República del Perú don Eduardo López de Romaña y nombrándose como su primera directora la señora Esther Santos. En un inicio no contaba con infraestructura educativa. Los hermanos Villanueva fueron los primeros nuñoeños que cedieron su domicilio para que funcione transición, primer año y segundo año de primaria. Posteriormente, se trasladó a la casa de la familia Barragán. La señora Paulina Guerra Pereyra de Guerra, una terrateniente de varios dominios e identificándose con la educación de las niñas de Nuñoa, donó uno de sus predios ubicado entre los jirones siglo XX y Puno. En ese sitio se levantó las primeras aulas de adobe con techo de paja mediante faenas de docentes y padres de familia. Pasaron los años y era urgente la creación de más tres años de estudio, es decir hasta el quinto año de primaria. Viendo esta necesidad, la Sra. Eloiza Murillo en coordinación con el alcalde señor Jesús Gamero Valdivia, canalizaron las gestiones respectivas ante el Ministerio de Educación, solicitud que ha sido aprobada y desde 1950 se autorizó el funcionamiento de primaria completa reconocida como “Escuela de Mujeres N° 869 de Nuñoa”
La Escuela de Mujeres, no contaba con una infraestructura adecuada, preocupada por esta realidad, la señora Ana Sánchez de Vegazo, Directora de ese entonces, mediante gestiones, consiguió el apoyo de los señores propietarios de las haciendas, quienes voluntariamente donaron calaminas y maderas, mas con la mano de obra de los padres de familia, se cambió el techo de paja por calamina. Con el correr de los años y el aumento de la población escolar, las aulas de la Escuela iban quedando antipedagógicas y con muchas carencias; viendo esta necesidad, la señora Elizabeth Sayhua de Begazo hizo una gestión ante Cooperación Popular, entidad del segundo gobierno de Fernando Belaunde Terry, que ha sido aprobada la construcción de las primeras cuatro aulas pedagógicas. Una de las primeras y grandiosas obras de material noble, ha sido por gestión de la Profesora Beri Cornejo Condori, Directora de la Escuela Primaria de Menores N° 70 479 por más de veinte años, de la entidad de gobierno central denominado FONCODES con sede en la ciudad de Puno, donde se logró la construcción de seis aulas, una batería de servicios higiénicos y mobiliario escolar, en el año 1996-1997. Posteriormente, se construyeron nuevos pabellones a dos niveles en el período de los alcaldes Victor Jesús Huallpa Quispe y Atilio Rodo Huamán Tapara. La primera banda de guerra, se formó en el año de 1986, siendo su director el recordado maestro nuñoeño Juan Silvestre, quien falleció dando toda su juventud y perseverancia por su añorada Institución Educativo que le tocó dirigir. La primera banda de músicos es gracias a la gestión de entonces la presidenta de APAFA la señora Alivia Mendoza de Soncco, quien consiguió la donación de instrumentos de la Municipalidad Provincial de Melgar. La Institución Educativa obtuvo varios lauros en cultura y deporte. Se llegó hasta Ayacucho en la disciplina de fútbol (2004), a la ciudad de Lima en ajedrez (2002) y hasta la ciudad de Arequipa en Concurso Nacional de Danzas Perú Minero 2008.