Šarūno Marčiulionio krepšinio mokykla įkurta 1992 metais. Rugsėjo mėnesį Vilniuje pradėjo treniruotis pirmieji 300 krepšinio mokyklos auklėtinių.
Tuo metu mokykla buvo įsikūrusi Vytenio gatvės patalpose, be to, buvo nuomojamos dar dvi krepšinio salės. “Būk savo valios viešpats ir savo sąžinės vergas” – tokį devizą Šarūnas Marčiulionis parinko savo krepšinio mokyklai. 1994 metais Vilniuje, Raitininkų gatvėje, iškilmingai atidaryti naujieji mokyklos rūmai. Per penkerius Š.Marčiulionio krepšinio mokyklos auklėtinių skaičius išaugo iki 600. "Ma
rčiulioniukai" mokėsi ne tik krepšinio gudrybių, bet ir visapusiškai lavinosi – studijavo anglų kalbą, dirbo kompiuteriais, mokėsi etikos ir estetikos pagrindų. Jaunieji krepšininkai iškovojo 5 Lietuvos čempionų titulus įvairiose amžiaus grupėse, aplankė 18 pasaulio šalių. Mokykloje jau buvo surengtas 21 krepšinio turnyras. Per dešimt metų jaunųjų krepšininkų, studijuojančių Š.Marčiulionio krepšinio mokykloje, skaičius išaugo iki 770. Su jais dirbo 10 profesionalių trenerių bei 4 papildomo ugdymo dėstytojai. Mokykloje buvo surengti 63 krepšinio turnyrai, iš kurių 24 – tarptautiniai. Š.Marčiulionio krepšinio mokyklos komandos rungtyniavo 26 užsienio šalyse, iškovojo 15 Lietuvos čempionų titulų įvairiose amžiaus grupėse.
2002 vasaros pabaigoje Šarūno Marčiulionio krepšinio mokyklai, švenčiančiai dešimties metų įkūrimo jubiliejų, tarptautinės krepšinio federacijos FIBA Europos taryba suteikė KREPŠINIO AKADEMIJOS statusą. Sveikinime Šarūnui Marčiulioniui, rašoma, jog akademijos statusas mokyklai suteikiamas už šios krepšinio mokyklos darbuotojų ir absolventų profesionalumą, didelį asmeninį Š.Marčiulionio indėlį ir nuopelnus Lietuvos krepšinio plėtrai bei įtaką Europos krepšinio augimui bei įvaizdžiui. Per penkiolika gyvavimo metų jaunųjų krepšininkų, studijuojančių Š. Marčiulionio akademijoje, skaičius išaugo iki 850. Su jais dirbo 11 profesionalių trenerių. Skirtingų amžiaus grupių komandos iškovojo net 23 šalies čempionų titulus ir 9 kartus tapo oficialių Europos jaunimo krepšinio lygos (EYBL) organizuojamų pirmenybių nugalėtojais bei prizininkais. Krepšinio akademijoje buvo surengti 96 krepšinio turnyrai, kurių – 32 tarptautiniai.
2002-2016 metais, įsikūrus Moksleivių krepšinio lygai (MKL), Šarūno Marčiulionio krepšinio akademijos auklėtiniai net 81 kartą rungtyniavo MKL Finalo ketverto varžybose. Jie iškovojo 71 medalių komplektą. Šiuo laikotarpiu akademijos krepšininkai 63 kartus kovojo finaluose dėl nugalėtojų vardų ir net 36 kartus tapo čempionais!
Šarūno Marčiulionio krepšinio akademijos auklėtiniai aplankė 27 užsienio valstybes Europoje, Azijoje, Amerikoje ir Afrikoje – Angliją, Argentiną, Australiją, Belgiją, Daniją, Graikiją, Ispaniją, Japoniją, JAV, Kanadą, Kroatiją, Pietų Afrikos Respubliką, Urugvajų ir daugelį kitų.
