Pociūnėliuose, dvarininko Scerbakovo sename dvare, įkurta mokykla. Mokykla stovėjo vakariniame Pociūnėlių bažnytkaimio pakraštyje, už Garduvos upelio, Scerbakovo dvaro pašonėje. Ji buvo pastatyta iš apvalių rastų. 1895 m. mokykloje dirbo rusas Mikalojus Dimša.
1899 m. pastatyti nauji nuosavi namai. Tikyba lietuviškai ir lenkiškai dėstė kun. Ignas Martinkus. Pirmąjį mokytoją pakeitė gudas Polesuk. Apie 1902-1903 m. buvo atidaryta Pociūnėliuose liaudies mokykla, vadinama „narodnaja uciliscia“. Tai buvo specialiai mokyklai skirtas pastatas, kuriame buvo du dideli kambariai: vienas - klasei, kitas skirtas mokinių bendrabučiui. Mokykla buvo 1-oji Gudžiūnų valsčiuje, kurią įsteigė caro valdžia. Nuo 1905 m., be rusų kalbos, buvo mokoma ir lenkų kalba. Iki 1-ojo pasaulinio karo mokykloje dirbo rusų mokytojai. 1914-1915 m. mokykloje buvo trys klasės. Kaizerinės okupacijos metais mokslas buvo nutrauktas. Mokinių skaičius sumažėjo iki 13. Buvo mokoma lietuvių ir vokiečių kalbos. Mokytojais dirbo Brazauskas-Braziūnas ir Matas Morkūnas. 1918 m. dirba mokytoja Lemkytė. Mokinių padaugėjo iki 30. buvo įsteigtas ketvirtas skyrius. 1925 m. mokykloje dirba mokytojai Cypliai. Nepriklausomos Lietuvos metu, Pociūnėlių pradinės mokyklos mokiniai jau baigia keturias klases, tačiau egzaminus laikyti važiuodavo į Gudžiūnus. Vėliau, išaugus moksleivių skaičiui, pociūnėliškiai egzaminus jau laikė savo mokykloje. Nuo 1930-1935 m. Pociūnėliuose mokytojauja Jakaitis su žmona, Siudikaitė, Pauraitė, Jonaitis.
1936 m. Pociūnėlių pradinė mokykla buvo perorganizuota į šešių skyrių pradinę mokyklą. Vadovavo mokyklai mokyt. Zavadskis. Tuomet joje mokėsi 150 mokinių, dirbo 5 mokytojai. Pirmieji tarybų valdžios metai didelių permainų neatnešė, - pradėjo veikti klubas - skaitykla. Vokiečių okupacijos metais vaikus mokė Jakaitis su žmona, Morkūnienė, Tvarijonaitė, Klimas.
1947 m. mokyklos vedėja paskiriama mokyt. Bielskytė-Rutkauskienė. Įsteigiama biblioteka, kurios vedėja - Daugvilaitė.
1949-1950 m. mokykla perorganizuota į septynmetę. 1952 m. išleidžiama 1-oji laida. Tuomet mokyklai vadovauja mokyt. J. Virbickas. Mokinių skaičius didėja, o patalpų trūksta. Todėl 1949 m. mokyklai perduodamas klebonijos pastatas. Tuo metu dirba 16 mokytojų, o vadovauja direktorius Jonas Gribačiauskas. Vėliau mokyklos direktoriumi tampa Aloyzas Daugėla. Jam vadovaujant, statomas mokyklos priestatas. Mokykla perauga į vidurinę 1959 m. išleista 1-oji abiturientų laida. 1960 m. mokykloje mokėsi 250 mokinių. Mokyklai vadovauja Sofija Zaleckytė.
1961 m. rugsėjo 1 d. mokytojai ir mokiniai įžengė į naujas dviejų aukštų mokyklos patalpas.
1963 m. spalio 18 d. mokykloje kilo gaisras. Šeimininkė Laniauskaitė, išgirdusi neįprastus garsus,prikėlė auklėtoją (Stankevičiūtę, Jurevičiūtę),. vaikus. Buvo išdaužti langai, gyvybės išgelbėtos. Išvykus S. Zaleckytei, direktore dirba E. Astrauskienė. 1970 m. mokyklos direktoriumi paskiriamas Pilibertas Taučius.
1979 m. prie mokyklos pristatytas priestatas su erdvia sporto sale, fizikos, chemijos, darbų kabinetais, valgykla.
1979/80 m. m. mokykloje mokėsi 298 mokiniai. Buvo 13 klasių. Nuo 1983 m. rudens mokyklos direktorius - A. Gailiūnas. Ilgiausiai Pociūnėlių vidurinėje mokykloje dirbę mokytojai yra šie: I. Rutkauskienė, M. Sadzevičienė, B. ir B. Poviloniai, E. Astrauskienė, J Galinauskienė, K. ir V. Petrišiūnai, G. Knizikevičiai, V Repečkienė, N. Macijauskienė, G. ir P. Taučiai, A. Adomelytė, V Sirtautienė, V. Bogušienė.