البيولوجية الجزيئية_Molecular biology

28/09/2025

آليات جديدة لحركة البكتيريا ونقل الحمض النووي بين البكتيريا تم فك شفرتها!

تُنظّم إشارات c-di-AMP عبر بروتين المستقبل ComFB آلية انقباض الشعيرات، التي تُمكّن البكتيريا من الحركة. تسمح هذه الآلية بنقل الحمض النووي من بكتيريا إلى أخرى.

تتحرك البكتيريا باستمرار بمساعدة أعضاء الحركة التي تُسمى الأسواط أو الشعيرات لاستعمار بيئات جديدة. كما يُمكن للبكتيريا تبادل المعلومات، مثل "التواصل مع بعضها البعض"، وبالتالي اكتساب قدرات جديدة من خلال تبادل مواد الحمض النووي.

تلعب هذه الأعضاء الحركية دورًا مهمًا في امتصاص الحمض النووي لتبادل المعلومات الجينية بين البكتيريا المختلفة، مما يُتيح ما يُسمى بالمرونة الجينومية. لذلك، تُساهم أعضاء الحركة البكتيرية في إمراضية البكتيريا، واستعمار العوائل، وتكوين الأغشية الحيوية، وانتشار مقاومة المضادات الحيوية.

في دراسات مشتركة، اكتشف علماء من جامعة هاينريش هاينه في دوسلدورف (HHU) وجامعة توبنغن، بالإضافة إلى جامعة غيسن وجامعة فرايبورغ ومعهد ماكس بلانك للبيولوجيا في توبنغن والمعاهد الوطنية الأمريكية للصحة وكلية الطب في نيوجيرسي، عائلة جديدة من بروتينات الإشارة، منتشرة على نطاق واسع في مملكة البكتيريا، وتساهم في تنظيم حركية البكتيريا وآليات امتصاص الحمض النووي.

نشر الباحثون نتائجهم في منشورين في مجلتي Cell Discovery وProceedings of the National Academy of Sciences.

في هاتين الدراستين، كشف فريق البحث بقيادة البروفيسور الدكتور خالد سليم (من معهد علم الأحياء الدقيقة الضوئية في جامعة هاينريش هاينه ومركز توبنغن للتميز CMFI) أن جزيئات الرسول الثانية (c-di-GMP وc-di-AMP)، إلى جانب بروتين مستقبل ComFB المكتشف حديثًا، تنظم كلاً من حركية البكتيريا وامتصاص الحمض النووي، مما قد يساهم في إمراضية البكتيريا.

دكتوراه قالت الطالبة شريهان سمير، المؤلفة الرئيسية لكلا البحثين: "إن قدرة بروتينات ComFB المختلفة من بكتيريا مختلفة على الارتباط بإشارة (إشارات) الحركة/امتصاص الحمض النووي ودمجها بدقة، تُسجلها ثنائيات النوكليوتيدات الرسول الثانية (c-di-GMP وc-di-AMP)."

وُجدت هذه الخصائص في البكتيريا الزرقاء، والعصوية الرقيقة، وضمة الكوليرا، العامل المسبب لوباء الكوليرا.

وأضاف البروفيسور سليم: "ينتمي c-di-AMP إلى فئة حديثة نسبيًا من الرسل الثانية من نوع ثنائي النوكليوتيدات الحلقية، والتي لم تُفهم وظائفها الخلوية بشكل كامل بعد. في هذه الدراسات، نُظهر أن بروتينات ComFB تستشعر c-di-AMP، بالإضافة إلى c-di-GMP، وهي ضرورية لتنظيم الكفاءة الطبيعية وحركة البكتيريا."

يصف مصطلح "الكفاءة الطبيعية" قدرة الخلايا البكتيرية على امتصاص جزيئات الحمض النووي ودمجها في جينومها الخاص لتبادل المعلومات الجينية فيما بينها. على سبيل المثال، تُسهم هذه العملية بشكل رئيسي في انتشار مقاومة المضادات الحيوية من عدد قليل من البكتيريا في البداية إلى مجموعات سكانية بأكملها، وكذلك عبر حدود الأنواع المختلفة.

لا يزال من غير الواضح أي مجموعات أخرى من البكتيريا - إلى جانب البكتيريا المدروسة - تستخدم هذه الآلية أيضًا. يقول سليم: "إذا استخدمتها البكتيريا المسببة للأمراض ذات الأهمية السريرية أيضًا، فقد يُمهد ذلك الطريق لاستراتيجيات جديدة لمكافحة البكتيريا متعددة المقاومة".
رابط المقال كامل
👇👇👇👇👇

https://phys.org/news/2025-09-mechanisms-bacterial-motility-dna-bacteria.html?fbclid=Iwb21leANF42hjbGNrA0XjZmV4dG4DYWVtAjExAAEeTm5HXmEgBTq6opZlqNgkLxBBDn4LMvjRHTxniCcfYXihBCi-IlevWCHqf_c_aem_MKSh5UdfCqWkl-L3bd65bg

Bacteria are constantly moving with the help of motility organs called flagella or pili to colonize new niches. Also, bacteria can exchange information, like "speaking to each other," and thus acquire new abilities through the exchange of DNA materials.

08/09/2025

ملف PDF شامل عن تطبيقات الـPCR

Clinical Application of PCR
https://drive.google.com/file/d/1qrdGE7ZB8ZYxuINcD6-GSr8_KSbLVdlZ/view?usp=drivesdk

16/08/2023

Design of gene expression assay by real time PCR
تصميم تجارب قياس التعبير الجيني بواسطة ال بي سي ار اللحظي :
يعتبر قياس التعبير الجيني اداة اساسية للكثير من الدراسات والميادين البحثية مثلا :
1- قياس تاثير الدواء على تعبير جين معين
2- معرفة تغير التعبير الجيني عند الاصابة بمرض معين
3- مقارنة الافراد ذوي الصفات المختلفة لمعرفة اساس اختلاف هذه الصفات
4- معرفة تاثير المعاملات المختلفة على لتعبير الجيني
5- هناك غيرها كثير من التطبيقات
هناك عدة تقنيات لقياس التعبير الجيني وقد تعرضنا لها بمنشور منفصل ويعد ال بي سي ار اللحظي هو اكثرها شيوعا لسهولته النسبية وثمنه المعقول :
هنا سيتمحور المنشور حول كيفية التخطيط لانجاز هذا الفحص بصورة صحيحة ومنهجية فهناك امور مهمة يجب الالتفات لها منها :
1- اختيار الجين المناسب : يجب التخطيط الدقيق لاختيار الجين المناسب المستهدف بعملية قياس تعبيره الجيني . حيث يجب ان يكون هذا الجين مسؤولا مباشرا او غير مباشر عن الصفة المراد دراستها او يتاثر بالمعاملات قيد التجربة .
2- اختيار النسيج المناسب لاستخلاص الرنا منه : التعبير الجيني يتغير من نسيج الى نسيج وهناك كثير من الجينات لا يعبر عنها مطلقا في انسجة معينة ويعبر عنها بانسجة اخرى . ولذلك حين اختيارك لجين معين يجب التأكد من كونه يعبر عنه ومهم في النسيج الذي تاخذ منه العينة .
3- يجب اخذ العينة انيا بعد المدة التي يتوقع ان يكون تاثير المعاملات على اشده او قمة ظهور الحالة المدروسة
4- يجب استخلاص الرنا انيا من العينة او حفظها باحد طرق الحفظ وهي
a- deep freez
b- trizol treatment
c- RNA later treatment
5- يجب ان تكون كافة الانابيب والادوات نظيفة وخالية من انزيمات الرنيز ويستعمل تبات حاوية على فلتر السليكا لتقليل التلوث ويجب استعمال ماء معامل بمادة الدبك
DEPC Treated Water for molecular biology
6- يحفظ الرنا المستخلص بالنتروجين السائل للفترات الطويلة او في -90 مؤي او في الفريز -20 للفترات القصيرة .
7- اختيار الطريقة الملائمة لاجراء ال بي سي ار : هناك عدة انواع سنتعرض لها بمنشور منفصل , اشهرها واقلها كلفة هي استعمال السايبر كرين او الايفا كرين او غيرها من الصبغات المتالقة .
8- اختيار الطريقة الملائمة لتحويل الرنا الى دنا بواسطة انزيم الرفرس ترانسكربتيز تتم هذه الخطوة بعدة انظمة ويجب اختيارها حسب الهدف وحسب الكائن ( تحتاج منشور منفصل للتفصيل ) على العموم هناك ثلاثة طرق مشهورة هي :
a- poly dT primer
b- Random hexamer or decamers
c- specific primer
9-selecting of normalization gene
اختيار جين المعايرة : في اغلب الحلات يجب اختيار جين اخر يعتبر كمرجع للمقارنة به هذا الجين يجب ان يختار بعناية بحيث يكون تعبيره الجيني مستقرا ولا يتاثر بالمعاملة او الحالة المراد دراستها . كيفية اختيار جين المعايرة تحتاج الى تفصيل طويل ولكن اسهل الطرق الاعتماد على البحوث الرصينة المنشورة .
10- اختيار الجهاز الملائم للعمل اذ يجب ان يحتوي على القنوات الضوئية اللازمة لاجراء التفاعل
11- التاكد من جودة القياس وصحته: يتوجب بعد اجراء التفاعل التاكد من صحة تقدير التعبير الجيني وهذا موضوع سنتركه لمنشور لاحق كونه مهم ومعقد بعض الشي .
ل
منقول من صفحة غاية المعرفة GAMA tec

10/08/2023

DNA and RNA electrophoresis
1- ان لكل من الدنا والرنا برتكول ترحيل كهربائي خاص به ولا يجوز ان يستعمل احدهما بدلا من الاخر
بالنسبة للدنا فعادة يستعمل الاكاروز وبفر الـTBE
اما بالنسبة للرنا فيتم ترحيلة بالاكاروز ولكن بنظام بفري خاص يحتوي عادة على الفورمامايد او القاصر
2- لا يمكن ملاحظة الرنا عند ترحيل ناتج الPCR كميته تكون جدا قليلة وتحت حدود التحسس وعليه كل الحزم التي نراها تكون عبارة عن حزم دنا .
3- يمكن ملاحظة الرنا بعد ترحيل ناتج استخلاص الحوامض النووية : غالبا ما يتحطم اغلب الرنا في عملية الاستخلاص فضلا عن كون اغلب بروتوكولات استخلاص الدنا تتضمن المعاملة بانزيم الرنيز والكفيلة بازالته كليا .
4- عند ترحيل ناتج استخلاص الحوامض النووية بدون المعاملة بانزيم الرنيز فهنا يمكن تمييز الرنا عن الدنا كونه يظهر على شكل حزمة عريضة او مسحة تنتشر على مسافة كبيرة نسبيا وغالبا ما تكون ذات وزن جزيئي قليل ( اقل من 250 زوج قاعدي )
5- قد يظهر الدنا بمواصفات شبيهة للرنا اي على شكل حزمة عريضة وذات وزن واطي وهذه ناتجة من تكسر الدنا نتيجة لاسباب كثيرة واغلب ما تشاهد هذه الحالة عند العمل على العينات المثبتة بالفورمالين
6- للتاكد من كون هذه الحزمة هي دنا او رنا فهنا يمكن معاملة العينة قبل الترحيل بانزيم الرنيز فاذا اختفت فهذا يدل على كونها عائدة للرنا اما اذا لم تختفي فهي دنا : والعكس بالعكس اي يمكن استعمال انزيم الدنيز واذا اختفت فهي عائدة للدنا .
كذلك يمكن استعمال بعض الصبغات التي تعطي تميز لوني بين الدنا والرنا مثلا صبغة الاكريدين اورنج يكون لون حزمة الدنا اخضر بينما لون حزمة الرنا احمر
7- لا يمكن التمييز في ما اذا كانت العينة حاوية على رنا او دنا بالطريقة الضوئية ( نانودروب او سبكتروفوتوميتر )
8- عند ترحيل الدنا الجينومي يظهر على شكل حزمة واحدة كما في الصورة 1
في حين عند ترحيل الرنا بنظامه البفري الخاص يظهر على شكل حزمتين عادة تمثل الرنا الرايبوسومي صورة2 .

شركة غاية المعرفة - الحلة - حي الجامعة- شارع الكليات الطبية - مقابل كلية

17/05/2023

موقع يحتوي MCQ
للمتقدمين على الدراسات العليا... BIOLOGY
https://www.sanfoundry.com/1000-biology-questions-answers-class-11/

منقول

1000+ Class 11 Biology MCQ PDF arranged chapter-wise based on CBSE, ICSE, NCERT, and State Syllabus Pattern! Practice Biology Class 11 MCQ for NEET, AIIMS, JIPMER, SAT, NTSE, Olympiad, online tests, quizzes, and interviews!

17/05/2023

مكونات جينوم الكائنات حقيقة النواة
Components of the Eukaryotic Genome ‼️

■ Unique Sequences

- Protein encoding genes-comprising upstream regulatory region, exons, and introns

- Genes encoding nontranslated RNA (snRNA, snoRNA, 7SL RNA, telomerase RNA, Xist RNA, a variety of small regulatory RNAs)

- Nonrepetitive intragenic noncoding DNA

■ Interspersed Repetitive DNA

- Pseudogenes

- Short interspersed elements (SINES)

- Alu element (300 bp). ~1,000,000 copies

- MIR families (average~130 bp). ~400,000 copies
(mammalian-wide interspersed repeats

- Long interspersed elements (LINES)

LINE-1 family (average ~800 bp) ~200,000-500,000 copies

LINE-2 family (average ~250 bp) ~270,000 copies

- Retrovirus-like elements (500-1300 bp) ~250,000 copies

- DNA transposons (variable; average~250 bp) ~200,000 copies

■ Tandem Repetitive DNA

- Ribosomal RNA genes
5 clusters of about 50 tandem repeats on 5 different chromosomes

- Transfer RNA genes
Multiple copies plus several pseudogenes

- Telomere sequences
Several kb of a 6 bp tandem repeat

- Mini-satellites (=VNTRS)
Blocks of 0.1-20 kbp of short tandem repeats (5-50 bp), most located close to telomeres

- Centromere sequence (α-satellite DNA)
171 bp repeat, binds centromere proteins

- Satellite DNA
Blocks of 100 kbp or longer of tandem repeats of 20-200 bp, most located close to centromeres

- Mega-satellite DNA
Blocks of 100 kbp or longer of tandem repeats of 1-5 kbp, various Locations

02/05/2023

🔸 الحصول على رسائل الماجستير وأطروحات الدكتوراه من أغلب جامعات العالم في جميع القارات، بشكل مباشر وعبر رابط واحد من خلال منصة Roar ، تستطيع البحث من خلال التخصص او الجامعة او السنة ، مفيد جدا للباحثين وطلبة الدراسات العليا وخاصة انه يوفر امكانية التحميل المجاني، الرابط اسفل
http://roar.eprints.org/view/

02/05/2023

Selected Mutagenic Agents and Their Effects
اختيار العوامل المطفرة وتأثيراتها

29/04/2023

فئات الطفرات النقطية وتأثيراتها‼ ️

تتراوح الطفرات من الطفرات الكبيرة ، التي يتم فيها اكتساب أو فقدان تسلسلات جينية كبيرة ، إلى الطفرات الصغيرة التي تؤثر فقط على قاعدة واحدة على الجين. تسمى هذه الطفرات الأخيرة ، التي تنطوي على إضافة أو حذف أو استبدال قواعد مفردة بالطفرات النقطية.

لفهم كيف يؤثر التغيير في الحمض النووي على الخلية ، تذكر أن رمز الحمض النووي يظهر بترتيب معين من ثلاثة توائم (ثلاثة قواعد) يتم نسخها إلى أكواد mRNA ، كل منها يحدد حمض أميني. يمكن أن يؤدي التغيير الدائم في الحمض النووي الذي يتم نسخه إلى mRNA وترجمته إلى تغيير بنية البروتين. يمكن أن يؤدي تغيير البروتين أيضًا إلى تغيير شكل الخلية ووظائفها. بعض الطفرات لها تأثير ضار على الخلية ، مما يؤدي إلى خلل في الخلية أو الموت ؛ هذه تسمى الطفرات القاتلة. لا تنتج الطفرات المحايدة تغييرات معاكسة أو مفيدة. بالطبع ، يمكن أن تكون الطفرات مفيدة أيضًا إذا زودت الخلية بتغيير مفيد في التركيب أو علم وظائف الأعضاء.

24/04/2023

القطعه النهائية Telomere 📷
📷 منطقة تسلسل نووي كثير التكرار يوجد عند نهاية الصبغيات
هو تسلسل متكرر من النيوكليوتيدات يقع في نهاية ( أطراف) الكروموسومات في معظم الكائنات الحية حقيقة النواه يتكون من 10000:8000 نيوكلتيدة
🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬
‏،هذا التتابع المتكرر لا يحمل أي شفرات لبناء RNA أو البروتينات Non_Coding region ,الكائنات بدائية النواه لا تمتلك Telomere لأنها ذات صبغي حلقي .
📷هذا التتابع هو TTAGGG ويتكرر حوالي 3000 مره ،يظهر أثناء تضاعف DNA , مع كل إنقسام للخلية يقل طول Telomere

🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬
‏من 30:20 Base Pair ,فالانقسام يؤدي إلي تقصير Telomere
فعند الولاده يكون 8000 BP , ومع تقدم العمر يصبح BP 3000
ثم BP 1500 إلى أن تصل الخلية لمرحلة الشيخوخة ثم الموت ،
ففي كل مرة تضاعف لا تستطيع أنزيمات التضاعف نسخ التسلسل الذي يوجد في نهاية الكروموسومات

🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬🧬
‏فيتوقف انزيم بلمرة DNA قبل النهاية ،فلو كان Telomere غير موجود لحدث فقدان للمعلومات الوراثية نتج عنه خلل في عمل الخلايا الحية ,كذلك يعمل علي منع تشابك الصبغيات مع بعضها ويساهم في ترتيب وتنظيم الصبغيات فهو يشكل غطاء واقي لنهاية الصبغيات مما يعمل علي احتفاظ الصبغيات بتركيبها .

14/01/2023

معجم موسع باللغة العربية
يتناول معاني أكثر من 17.000 مصطلح علمي
متخصص ومعاصر باللغة الإنجليزية
في علوم الكيمياء الحيوية والجينوم
والبيولوجيا الجزيئية والعلوم الأخرى

رابط المعجم :
https://biochemistry-ar.org/HomePageAr.aspx

03/01/2023

‏الكروماتين المتغاير والكروماتين الحقيقي

تحتوي الكروموسومات على تكوين منتشر أثناء الطور البيني لدورة الخلية. ستخضع الخلية لتكرار الحمض النووي خلال المرحلة S من الطور البيني ووجود الحمض النووي غير المكثف ويمكن الوصول إليه يجعل العملية أكثر كفاءة.