SMA Santo Thomas 2 adalah salah satu sekolah unggulan di Kota Medan. Sekolah ini sudah banyak menghasilkan lulusan yang unggul di masyarakat baik di dalam negeri atau di luar negeri. Sekolah ini adalah sekolah milik Keuskupan Agung Medan, yang dikelola oleh Yayasan Perguruan Katolik Don Bosco. Sekolah ini memiliki gedung yang luas terdiri dari delapan lantai, dengan ruangan yang memadai dan difa
silitasi dengan baik. Setiap kelas memiliki AC dan Kipas, Multimedia dan komputer yang terhubung dengan internet. Sekolah ini juga memiliki satu ruangan yang difungsikan sebagai Kapel mini tempat siswa-siswi yang beragama Katolik dan Kristen dapat melakukam doa devosi atau menyelenggarakan perayaan Ekaristi. Sekolah ini juga memiki laboratoriun Kimia, Fisika, Biologi dan Komputer yang sangat profesional. Juga dilengkapi dengan perpustakaan digital. Halaman sekolah sangat luas dan asri dengan bunga dan pepohonan hijau yang sejuk serta dilengkapi dengan lapangan parkir untuk kendaraan bermotor yang cukup luas. Semua guru dan pegawai yang berkarya di sekolah ini merupakan SDM yang mumpuni, dengan gelar Sarjana Strata Satu dan Dua. Kepala sekolah yang pernah memimpin di sekolah ini adalah :
Drs. Simbolon dari Tahun Pelajaran 1980/1981 s/d T.P. 1986/1987
Drs. Sihotang dari T.P. 1987/1988 s/d T.P 1996/1997
Drs. Situmorang dari T.P. 1997/1998 s/d 1998/1999
Drs. Sitohang dari T.P. 1999/2000 s/d 2010/2011
Dra Agnes Rumapea dari TP 2011/2012 sd 2012/2013
Drs. Nelson Nababan, M.Si TP 2013/2014 sampai sekarang
