Sekolah Menengah Atas Katolik Giovanni Kupang, satu-satunya sekolah menengah atas berprestasi di Kota Kupang dan telah meloloskan ribuan orang "sukses" di Nusa Tenggara Timur. SMU katolik Disamakan Giovanni Kupang sebagai lembaga pendidikan swasta dalam kiprahnya selain mengembara visi dan misi pendidikan katolik tetapi tetap dalam konteks upaya mencerdaskan kehidupan bangsa secara makro sehingga
sejak didirikan hingga saat ini telah mengikuti berbagai jenjang akreditasi dari pemerintah dalam hal ini Departemen Pendidikan dan Kebudayaan RI sebagai berikut :
- Berdasarkan Surat Keputusan Direktur Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan No. 018/C/Kep/I/83 tentang syarat dan tata cara pendirian Sekolah Swasta ; tanggal 7 Juli 1983; diputuskan bahwa SMA Katolik Giovanni Kupang ditetapkan sebagai SMA Swasta dengan status “TERDAFTAR”
- Berdasarkan Surat Keputusan Direktur Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan No. 007/C/Kep/I/85 tentang Jenjang Akreditas bagi Sekolah Lanjutan Tingkat Atas ; tanggal 6 Pebruari 1985; diputuskan bahwa SMA Katolik Giovanni Kupang ditetapkan sebagai SMA Swasta dengan status “DIAKUI”
- Selanjutnya melalui Surat Keputusan Kepala Kantor Wilayah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Propinsi NTT No. 7572/I.21/I/92; tentang Penetapan/Penunjukan Sekolah-sekolah :SD,SMP dan SMA Model di 12 Kabupaten se-NTT tahun 1992/1993; tanggal 17 Oktober 1992; diputuskan bahwa SMA Katolik Giovanni Kupang ditetapkan sebagai “Sekolah Model” di Propinsi NTT.
- Berdasarkan Surat Keputusan Direktur Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan No. 024/C/Kep/I/95; tanggal 22 Maret 1995 tentang Jenjang Akreditas bagi Sekolah Lanjutan Atas Swasta; diputuskan bahwa SMA Katolik Giovanni Kupang ditetapkan sebagai SMA Swasta yang berhak memiliki status “DIAKUI” dengan nilai 92 dari nilai tertinggi 100 yang disyaratkan oleh panitia Akreditas sehingga dari 10 SMA Swasta di NTT yang akreditasnya pada tahun 1995, SMA Katolik Giovanni Kupang merupakan SMA Swasta yang tertinggi nilainya pada akreditas periode tersebut.