Le 1 er octobre 1878, une équipe de 5 Frères ayant à sa tête le Frère Antélius ouvre le premier Saint Joseph de Pantin. En 1890, la Maison Mère des Frères fit édifier les bâtiments, rue du canal.
1903 – 1904. Ce sont les lois antireligieuses contre les congrégations enseignantes. Saint Jo aussi. En octobre 1909 l’école de Pantin fut achetée par un ami des Frères, évitant ainsi la spoliation. En
1929, c’est la construction d’un nouveau corps de bâtiment au 139 rue de Paris. Ouverture d’un Patronage, avec ses multiples activités, les cercles d’hommes ou d’étudiants. Le 1 er janvier 1930, la maison de Pantin redevient la propriété des Frères.
1948, on entend les premières rumeurs d’expropriation. L’école sera transportée près de l’église, de l’autre côté de l’avenue.
1950 – 1965, menacée de fermeture… l’école est sauvée par le renouveau suscité par le Concile et le Chapitre Général des Frères en 1966. On n’y avait beaucoup parlé des pauvres, des secteurs défavorisés … Il fallait passer aux actes … et en 1966, un beau matin, 5 Frères vinrent de l’Ouest continuer l’œuvre de Pantin. En 1969, construction du bâtiment du 12 avenue du 8 mai 1945. Le nouveau saint Joseph est né et accueille 488 élèves à la rentrée
Entre 1969 et 2009, l’école saint Joseph passe de 17 à 40 classes, de 488 élèves à 950 élèves. En 1971 – L’école Sainte-Marie tenue par les sœurs de Saint-Vincent de Paul est dévolue aux Frères des Ecoles Chrétiennes. L’école maternelle et le CP s’y installent.
1974 – acquisition du gymnase, rue Jean Nicot, avant la construction en 1989, d’un nouveau bâtiment pour abriter un nouveau gymnase et la SES / SEGPA.
1974, mise en place des Antennes Mobiles et achat du terrain d’horticulture à Epinay Sur seine
Entre 1975 – 1995
Peu à peu, les réformes pédagogiques, les choix éducatifs amènent à scolariser au collège, tous les types d’élèves et le plus longtemps possible. C’est pour cette raison que le collège croît régulièrement, développant et adaptant ses structures, poussant en avant ceux qui ont le plus de facilité, soutenant ceux qui ont le plus besoin d’aide.
1989 marque une étape importante ; Saint Joseph est le premier établissement de l’enseignement catholique d’Ile de France à ouvrir une structure adaptée aux élèves en grande difficulté : la S.E.S. (section d’enseignement spécialisé) devenue aujourd’hui l’E.G.P.A. (Enseignement général et professionnel adapté).
2010 Inauguration d’un nouveau bâtiment comprenant un auditorium. Rentrée 2011: L’ensemble scolaire compte à cette rentrée 1050 élèves