En ese mismo año ingresó a dicha institución un grupo de jóvenes que venían de distintas partes del país para formarse a nivel vocacional en el orden sacramental del sacerdocio. Los participantes realizaban sus estudios secundarios en diferentes centros educativos de Santiago, ya que en Licey no había un liceo. A raíz de la situación de violencia y persecución los adolescentes y jóvenes protestaba
n en las calles y liceos públicos. Esto generó irregularidades en el cumplimiento del horario escolar y ponía en riesgo la vida de los seminaristas. Estas dificultades motivaron a padre Jesús María de Jesús Moya (hoy Obispo Emérito por la Diócesis de San Francisco de Macorís) pidió a la Secretaría de Educación en ese entonces, actualmente el MINERD, la autorización de que los seminaristas reciban la docencia en las instalaciones del Seminario. La petición fue aprobada, y en el 1968 comenzó a funcionar el Liceo Seminario Menor San Pío X. En el centro se le dio la oportunidad a que estudiantes no seminaristas formarán parte de su matrícula, dando apertura a la asistencia de estudiantes de los ambos sexos de las diferentes comunidades aledañas. Durante la década del 70 se suprimieron el primer y segundo grado, por ello los estudiantes los recibían en el liceo hoy conocido como Politécnico Profesora Mercedes Peña de Licey. Al final de dicha década y a principios de los 80, en el Liceo Seminario San Pío X sólo se impartía el cuarto grado (actualmente sexto) y los demás grados se hacían en el Liceo Profesora Mercedes Peña. Esto permitió el desarrollo de una efectiva y afectiva relación entre ambas instituciones. A mediados de los 80, nuevamente en el país se vivía una difícil situación. Las constantes manifestaciones de protestas, principalmente en el sector magisterial, provocaron que el horario escolar no se cumpliera, y al mismo tiempo ponían en riesgo el bienestar y vida de los estudiantes y otros agentes de la comunidad educativa. En consecuencia, a petición del padre Vinicio Disla (fallecido), se volvieron a impartir los cuatros grados del bachillerato (actualmente los últimos cuatro grados del nivel secundario). Sin embargo, el Liceo Seminario San Pío X fue institucionalmente reconocido en enero del 1990 por la entonces Secretaría de Educación Bellas Artes y Cultura, hoy MINERD.
