Santa María del Río fue creada en el año de 1994 por iniciativa del presidente de la junta de acción comunal de la vereda La Balsa sector Las Juntas, se da en comodato por 5 años las instalaciones al Gimnasio Los Caobos, institución educativa de carácter privado para que comenzara a funcionar como centro educativo en febrero de 1994; dicho término no fue efectivo por mutuo acuerdo de las partes. S
egún solicitud hecha a la Secretaria de Educación Municipal el 20 de septiembre de 1196 se obtuvo la licencia de funcionamiento para la prestación del servicio educativo formal para el nivel de preescolar, plantel de naturaleza privada de carácter mixto, calendario A y jornada única con el nombre de Colegio Santa María de los Caobos, con resolución No 01454 a finales de 1991 el colegio es declarado Colegio Municipal y se nombra rector encargado para año 2000 y a toda la planta docente. En los años 2001 y 2002 el Alcalde nombra nuevamente rectora encargada, quien deja aprobado el colegio hasta grado noveno con una planta de 13 docentes municipales. En el año 2001 se aprobó oficialmente la primaria y básica secundaria mediante resolución No 00275 de mayo 24, bajo la resolución No 3344 de octubre de 2002; el colegio se convierte en Institución Educativa Departamental Santa María del Río. Por las reformas educativas se nombra rectora de planta, quien en el año 2003 inicia con un total de 17 docentes nombrados por orden de prestación de servicios una secretaria paga por el Fondo de Servicios Docentes, con un total de 417 estudiantes distribuidos en los niveles de preescolar, básica primaria y básica Secundaria. La institución ha ampliado la cobertura académica paulatina y es así que hoy ofrece servicio hasta grado once completando el ciclo de educación Media cuya aprobación está plasmada en la resolución No 004365 de 23 de diciembre de 2004, según encuestas realizadas a los estudiantes de grado octavo y noveno, a los padres de familia y docentes se detecta gran interés por implementar el énfasis del colegio hacia la formación turística y hotelera en el área de manipulación de alimentos y bebidas. En el año 2005 el colegio es seleccionado por la Ministra de Educación como institución piloto para probar un modelo pedagógico exitoso de un colegio privado en una institución educativa oficial: el SERF, sistema de educación Relacional Fontán, del colombiano Julio Fontán García, el colegio cambia su modelo de educación tradicional a un modelo de innovación pedagógica basado en el fomento de la autonomía orientando a los estudiantes en la construcción de su propio conocimiento de una manera personalizada convirtiéndose en la primera institución pública colombiana en implementar este modelo con mucho éxito y esto convierte a Santa María del Río en una institución reconocida nacional e internacionalmente por tan buenos resultados y gracias a un trabajo en equipo de construcción pedagógica, compromiso y sentido de pertenencia de los docentes y directivos con el apoyo de toda la comunidad educativa.