A FAJ, no desenvolvimento de suas atividades estatutárias, observa os princípios da legalidade, impessoalidade, moralidade, publicidade e eficiência.
Para a consecução dos fins previstos em seu Estatuto e para o aperfeiçoamento de suas atividades, a FAJ estimula os trabalhos de pesquisa através de apoio material ao pesquisador; promove e realiza cursos, seminários, simpósios e estudos, em especial aqueles relacionados com seus objetivos estatutários; patrocina o desenvolvimento de novos produtos, equipamentos, sistemas e processos de interesse
médico-hospitalar; promove a divulgação de conhecimento tecnológicos e edita publicações técnicas e científicas; institui bolsas de estudos e estágios, assim como assistência a estudos de estagiários, técnicos e pesquisadores que possam contribuir para a consecução da finalidade e objetivos da FAJ; capta recursos financeiros junto à iniciativa privada, agências financiadoras oficiais e entidades congêneres no Brasil e no exterior; apoia o desenvolvimento de ações de pesquisa, de ensino e desenvolvimento institucional nas suas áreas de atuação; aplica recursos na formação de um patrimônio rentável; apoia o desenvolvimento de projetos pesquisa científica e de inovação tecnológica; apoia ações sociais dirigidas por voluntariado, entre outras atividades. Para a consecução de seus objetivos a FAJ celebra convênios, contratos, acordos, termos de parceria e outros ajustes, com entidades públicas e privadas, nacionais ou estrangeiras; cria centros de pesquisas e agências que tenham por fim melhorar a qualidade de vida das comunidades. A FAJ adota práticas de gestão administrativa, necessárias e suficientes a coibir a obtenção, de forma individual ou coletiva, de benefícios ou vantagens pessoais, em decorrência da participação no respectivo processo decisório. O patrimônio e os recursos da FAJ são aplicados integralmente na manutenção e desenvolvimento dos objetivos institucionais, no território nacional, considerando-se a segurança dos investimentos e a manutenção dos valores reais do capital investido.
