23/12/2020
Compartilhamos abaixo o aceite do nosso mais recente estudo intitulado “BOPS: A Matlab Toolbox to Batch Musculoskeletal Data Processing for OpenSim” no periódico Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering.
O estudo foi realizado pelo integrante Bruno Bedo na Universidade de Ottawa paralelamente às atividades de seu doutorado. O projeto BOPS foi realizado por pesquisadores de diferentes países: Me. Bruno Bedo (Brasil/Canadá), Dra. Alice Mantoan (Itália), Dr. Danilo Catelli (Canadá), Willian Cruaud (França/Canadá), Dra. Monica Reggiani (Itália) e Dr. Mario Lamontagne (Canadá).
BOPS é um conjunto de scripts em MATLAB elaborados para otimizar o processamento das análises mais comuns realizadas no OpenSim. Ele foi elaborado e lançado, primeiramente em 2016, em uma versão teste (v0.9), pelas pesquisadoras Dra. Monica Regiani e Dra. Alice Mantoan, ambas da University of Padua – Itália.
Posteriormente, durante o doutorado sanduíche do aluno Bruno Bedo na Universidade de Ottawa (Canada), em conjunto com os pesquisadores Dr. Danilo Catelli, Dr. Mario Lamontagne e Willian Cround, a ferramenta foi totalmente atualizada e novas análises implementadas, resultando no BOPSv2.0.
Atualmente é possível realizar as análises mais comuns realizadas no OpenSim (Inverse Kinematics - IK, Inverse Dynamics - ID, Muscle Analysis - MA, Static Optimization - SO, e Joint Reaction Analysis - JRA), salvar os outputs, logs, setups e figuras, tudo de modo automático.
Para isso, foi elaborado um GUI (Graphical User Interface) em MATLAB para otimizar e facilitar todo o processo de análise. O BOPS utiliza as APIs do OpenSim, o que tornam os resultados idênticos aos calculados diretamente no OpenSim.
Por se tratar de um projeto open-source, gostaríamos de compartilhar com os amigos e pesquisadores da área, visando ouvir críticas, dicas e, por que não, auxiliar no processamento de dados e ensino da biomecânica.
O projeto BOPS pode ser acessado na página do SimTK:
- Projeto: https://simtk.org/projects/bops
- Download: https://simtk.org/frs/?group_id=1038
- Anúncio oficial BOPS v2.0:
https://simtk.org/plugins/phpBB/viewtopicPhpbb.php?f=1038&t=12239&p=0&start=0&view=&sid=08522e48dde22c2d9b3db371e05f53ad
O repositório com todos os scripts e templates pode ser encontrado no Github: https://github.com/RehabEngGroup/BOPS/releases/tag/v2.0
Além disso, também disponibilizamos na página do SimTK um conjunto de dados para testagem e um vídeo tutorial, mostrando a funcionalidade desta nova ferramenta.
- Vídeo tutorial: https://simtk.org/docman/?group_id=1038
Parabenizamos os pesquisadores por esse incrível projeto e pelo aceite do artigo!