Constituída de 25 salas de aulas, obedecendo aos padrões de qualidade exigidos pela Resolução nº. 0082/2000 CEE, dois pátios, uma coordenadoria, diretoria pedagógica, diretoria administrativa financeira, um departamento de informática, uma secretaria, uma tesouraria, um almoxarifado, uma cantina, uma videoteca, uma brinquedoteca, um auditório, sala de professores, 6 bateria de banheiros cada um co
m 4 cabines, 3 salas de multimídias, auditório, uma biblioteca e quadra de esporte para atendimento à comunidade, um espaço construído para acolher 1.000 alunos distribuídos nas modalidades de ensino da educação básica. Os alunos matriculados no Centro Educacional São Francisco de Assis são oriundos da classe média, onde grande maioria reside em Paço do Lumiar. Para o ingresso dos alunos para o fundamental e médio submetem-se a um processo seletivo tendo provas de Língua Portuguesa, Matemática e uma entrevista.
