O Colégio Cônego Francisco Pereira foi fundado em 15 de outubro do ano de 1983 pelo casal Cincinato e Cesarina, educadores por vocação. O casal nomeou o colégio através da escolha do patrono, Padre Pereira, pároco de Messejana que possuía o título honorífico de Cônego por seu reconhecimento, dedicação e serviços prestados ao reino de Deus. O Colégio Cônego começou a funcionar com apenas quatro sal
as de aulas e outras pequenas salinhas aonde, por algum tempo, funcionaram a diretoria, secretaria, sala de professores e cantina, perfazendo, à época em metros quadrados, uma área total de menos de dez por cento da área atual. A dedicação, a disciplina e o empenho são os responsáveis pelo grande salto estrutural (físico e pedagógico). Hoje com 30 anos de existência, o Cônego se apresenta como um colégio completo e referência no bairro de Messejana. Ao longo destes anos a Instituição passou por diversas ampliações e hoje conta com uma excelente estrutura. Sua ampliação física trouxe também uma grande ampliação intelectual, com professores, orientadores, psicólogos e demais profissionais, amplamente capacitados para continuar fazendo do Cônego uma das melhores escolas da capital cearense.
