O Complexo de Saúde da FURB é formado pela Policlínica Universitária, CER II, Clínica de Fisioterapia e Lab. Os serviços de saúde da FURB, desde 1995, inseridos na rede pública de saúde, são executados de forma integrada na Policlínica Universitária que realiza os serviços de fisioterapia, psicologia, nutrição, farmácia, medicina e serviço social. A Policlínica mantém em sua estrutura laboratório de análises clínicas e farmácia - com estoque de medicamentos mantidos pelo Sistema Único de Saúde - SUS e por doações de indústrias farmacêuticas. Para consultas e atendimento médico especializado, o paciente obrigatoriamente é encaminhado pela Unidade de Saúde mais próxima de sua casa, exceto para consultas no ambulatório de Síndrome de Down podem ser marcadas diretamente na recepção. A Policlínica não realiza atendimento de urgência e emergência. O Hospital Regional Universitário da FURB dispõe de uma ala de consultórios especializados que disponibiliza à comunidade consultas de clínica cirúrgica divididas em 08 especialidades: cirurgia geral adulto, cirurgia ambulatorial, cirurgia vascular, otorrinolaringologia, neurocirurgia, oncologia cirúrgica, proctologia e ortopedia. Também dispõe de atendimento especializado multiprofissional para tratamento de feridas. Conta com um centro cirúrgico com salas equipadas para atendimento de cirurgias de pequena e média complexidade. Na ala de Diagnóstico realiza eletroneuromiografia e eletrocardiograma. Todas as consultas e procedimentos são feitos por acadêmicos da FURB, supervisionados por profissionais de cada área. O atendimento é gratuito e segue os critérios definidos pelo SUS, ou seja, todos os pacientes são encaminhados pela rede de saúde de Blumenau e região.
