139 ОУ носи името на един от първите български учители-просветители – Захарий Круша.
Захарий Попхристов Икономович-Круша, роден на 11 февруари, 1820 г. в гр. Самоков, е един от първите ученици на Неофит Рилски. Учителства в София, Враца, Самоков, Одрин, Панагюрище, Радомир. Взел е активно участие в борбата за черковна свобода. Има заслуги за разпространението на взаимо-учителната метода и в борбата против гърцизма. Подкрепя идеята за образованието на девойките. Превежда от гръцки език, оставил е сборник "Песни различни от майка ми казани", записва народни песни и пословици от Самоков и София.
Училище "Захарий Круша" е създадено през 1960 г. и стартира работата си на 1 септември, същата година, с 978 ученика, разпределени в 27 паралелки – 16 в началния курс и 11 – в средния.
През втората учебна година 1961/62 се утвърждава общоучилищния ред, сплотява се учителският колектив, увеличават се и успехите в извънкласната дейност.
През десетата година са завоювани още по-добри резултати в учебно-възпитателната работа. Утвърденият учителски колектив начело с директора Иван Павлов, разработват и прилагат методическата и извънкласна работа.
През 1971/72 учебна година директор е Пенчо Колев, а от 1973 г. ръководството се поема от Недялка Гинева и Парашкева Маринова – зам. директор. Те си поставят за цел да изучат системата в работата на отделния преподавател, нивото на неговата научна и методическа подготовка. Добри постижения колективът постига при диференциране на самостоятелната работа в час и при индивидуалната работа с всеки ученик. Основна задача през този период е внедряването на комплексния подход с цел оптимизиране на учебно-възпитателната работа. Дейността се насочва към изграждане на социални ценности в учениците, които подпомагат сформирането на личностна позиция.
От 1 септември, 1976 г. директор е Цонка Димова. Зам. директори са Ненчо Иванов, Младен Павлов и Дилко Дилков. През тази учебна година в училището са записани 700 ученика, разпределени в 22 паралелки, 9 в началния курс и 13 в средния. Две от паралелките в средния курс са със спортен профил по плуване. Към училището функционират и 7 полуинтернатни групи, чиито занимания се водят извън училищната сграда.
От 1990 до 2001 г. директор е Весела Дренчева. Въведен е организиран транспорт в училището. Броят на учениците е 226, разпределени в 12 паралелки.
От 2001 г. и към момента директор на училището е Румяна Дончева. Броят на учениците е 303, разпеределени в 15 паралелки. През този период в организацията на образователния процес са направени следните подобрения:
- изградено е столово помещение, в което се хранят до 100 деца;
- обновена е лавката на училището;
- положена е нова асфалтова настилка в двора на училището;
- фасадата на сградата е изцяло обновена;
- сменена е дограмата, подменена е ВиК инсталацията, изцяло обновени са санитарните възли;
- изграден е компютърен кабинет;
- обновена е учителската стая;
- обновени са класните стаи;
- основно ремонтиран е физкултурният салон;
- педагогическият персонал е допълнително квалифициран или преквалифициран, съгласно нуждите на образователния процес;
- внедрена е система за поддръжка и управление качеството на обучение;
- въведена е ученическа униформа;
- осигурява се транспорт за 30% от учениците.
