OMICS Bangladesh

25/09/2026

🧬 Introducing Bioinformatics Tools — Your Browser-Based Research Toolkit! 🔬

Exciting news for researchers, students, teachers, and life-science laboratories! 🚀

We’ve developed an open suite of browser-based bioinformatics utilities for molecular biology, genetics, genomics, microbiology, biotechnology, and structural biology.

✨ 20+ research tools — no installation, no registration!

Some of the available tools include:

🧬 CRISPR gRNA Design — gRNA design & off-target analysis
🔬 Primer Design Suite — PCR, RT-qPCR, inverse & nested primers
🎛️ Promoter Analysis — promoter elements & TF-binding site prediction
📈 qPCR Analysis Suite — ΔCt, ΔΔCt, fold change & statistics
📊 GWAS Bioinformatics — association analysis, OR, FDR & Bonferroni
🧾 SNP / Indel Analysis — alignment, variant calling & consensus
🗺️ QTL Analysis — linkage mapping & QTL detection
🦠 MicrobiomeLab — diversity analysis, PCoA, PERMANOVA & heatmaps
🧬 MetaGenome Suite — metagenomic analysis & report generation
🦠 PathogenSuite — AMR, virulence factors & secretion systems
🧩 ContactMap Analyzer — protein–protein, protein–ligand & nucleic-acid contacts
🧪 ChemoMetrics Studio — DFT, molecular descriptors & QSAR
📊 BioStat Suite — statistical analysis, PCA, regression & clustering
🧫 Plasmid / Construct Design — cloning, Gibson, Golden Gate & mapping
🧪 Virtual Agarose & Protein Gels — simulate electrophoresis
🧪 TLC & Paper Chromatography — Rf analysis
⚗️ SMILES → Rf Predictor — structure-based Rf prediction
🌱 Plant Tissue Culture Toolkit — callus, regeneration & growth analysis
🧬 Protein & Enzyme Function Prediction — function, EC class, localization, motifs & more

🌐 Explore the tools:
tools.omics.bd

No installation.
No registration.
Research-focused.
Browser-based. 🧬💻

Developed by Md Mahmudur Rahman, Omics Bangladesh & Mohammad Nurul Islam, Department of Botany, University of Dhaka.

🔬 For researchers. For students. For biological science laboratories.

12/07/2026

🧬 From Hub Gene to Journal-Ready Manuscript — Learn the Full Cancer Bioinformatics Pipeline

Modern cancer research doesn't stop at the bench anymore. The papers landing in top journals today run on one connected pipeline — expression databases, network biology, virtual screening, and molecular simulation — from gene to manuscript.

OMICS Bangladesh is now teaching that exact pipeline, live, start to finish.

📚 Cancer Bioinformatics & Computational Drug Discovery
From Hub Gene Identification to a Journal-Ready Manuscript

🗓️ 20 Classes | 10 Weeks | Starts 01 August 2026
💻 100% Online & Live on Zoom | 2 Classes/Week, 40+ Contact Hours
👥 Individual or Group Projects
🎖️ Certificate of Completion from OMICS Bangladesh
🏆 Outcome: A complete, journal-ready manuscript
💰 Fee: ৳5,000/person (Group discounts up to 30%)

✅ What you'll actually do:
🔹 Mine RNA-Seq/microarray data from GEO & TCGA
🔹 Build PPI networks and identify hub genes (Cytoscape, STRING)
🔹 Run survival analysis, ROC curves & pan-cancer correlation
🔹 Study immune infiltration and regulatory miRNAs
🔹 Virtually screen natural product libraries against multiple targets
🔹 Evaluate ADMET, toxicity & off-target effects
🔹 Run MD simulation with MM-GBSA binding free energy
🔹 Write and format your manuscript for journal submission

🎓 Who it's for: BSc/MSc students, MPhil/PhD researchers, faculty, and early-career researchers in Biotechnology, Pharmacy, Microbiology, Biochemistry & related life sciences. No prior programming or bioinformatics experience needed — we build from the fundamentals up.

By Class 20, every participant walks away with one real project — one cancer type, one gene/pathway — carried through the entire pipeline to publication-ready data.

Seats are limited to keep hands-on mentorship available for every participant. 🔬

👉 ENROL NOW — link in first comment or Scan QR Code, or call 01866-288220 for registration & group discount queries.

17/03/2026

Hands-on Bioinformatics Training: Antimicrobial Resistance and Pathogenicity Prediction in Bacterial Genomes

Course Duration: 6 hours

Target Audience: Graduate students, researchers, and professionals in microbiology, bioinformatics, or related fields

Mode: ONLINE ¦ Computer-based practical session
__________________________________________________________________

Course Objectives:

By the end of this session, participants will be able to:

1. Understand the concept of antimicrobial resistance (AMR) and pathogenicity in bacteria.
2. Identify antimicrobial resistance genes (ARGs) in bacterial genomes using online tools.
3. Predict the pathogenic potential of bacterial genomes in humans.
4. Interpret results and link findings to clinical or environmental relevance.
____________________________________________________________________

Learning Outcomes:

At the end of this 6-hour course, participants will:

• Perform genome-based identification of antimicrobial resistance genes.
• Predict bacterial pathogenicity toward humans using computational tools.
• Interpret and critically analyze bioinformatics outputs.
• Relate genomic findings to real-world clinical or environmental contexts.
_____________________________________________________________________

Recommended Pre-Requisites:

• Basic knowledge of microbiology and genomics.
• Familiarity with FASTA format and genome sequence data.
• Access to a laptop with internet connectivity.
_________________________________________________________________

Date: 10 and 11 April (Friday and Saturday)

Time: 7.30 PM to 10.30 PM

Mode of Learning: ONLINE (Zoom Platform)
___________________________________________________________________Fees: 500 Taka per participant for Student and 825 Taka for Professionals
____________________________________________________________________

Registration Link is in the first Comment.

21/10/2025

🎓 Cancer Genetics and Bioinformatics Course

📍 Organized by the OMICS Bangladesh

🔷 Preamble

The Cancer Genetics and Bioinformatics Course is designed to bridge cancer biology and computational analysis, offering learners a modern perspective on the molecular mechanisms of cancer.
This four-week intensive program provides both theoretical understanding and hands-on bioinformatics practice, empowering participants to explore tumor genetics, gene expression data, and molecular signatures that define cancer initiation, progression, and metastasis.

🎯 Objectives

✅To introduce participants to the fundamental concepts of cancer genetics and molecular mechanisms.
✅To explain tumor initiation, progression, and metastatic behavior at the genetic level.
✅To train participants in bioinformatics tools and databases used for analyzing cancer datasets.
✅To provide practical knowledge on hub gene identification, enrichment, and pathway analyses.
✅To enhance analytical skills through survival analysis, proteomics, miRNA, and immune profiling.
✅To encourage critical thinking and presentation of data-driven cancer research projects.

🧠 Expected Learning Outcomes

Upon successful completion, participants will be able to:

✅ Comprehend the molecular basis of cancer development and progression.
✅ Analyze differential gene expression and identify hub genes.
✅ Perform pathway, GO, and survival analyses using public cancer databases.
✅ Interpret protein, RNA, and miRNA expression patterns in tumors.
✅ Evaluate immune infiltration and drug sensitivity data.
✅ Prepare and present a mini research project on cancer bioinformatics.

⏰ Course Duration

📆 Total Classes: 15 (2 hours per class)
🕒 Total Duration: 4 Weeks

💰 Course Fees

💳 Individual Participant: 2500 Taka

👥 Group Discounts:

3–4 participants → 10% waiver

5–9 participants → 15% waiver

10+ participants → 20% waiver

👨‍🔬 Who Can Join

Students and researchers from Biotechnology, Genetic Engineering, Bioinformatics, and Allied Life Sciences

Professionals and educators interested in cancer data analysis, genomics, and molecular research

📢 Highlights

✨ Interactive, research-oriented sessions
✨ Real datasets and analytical tools
✨ Certificate of Completion
✨ Guided Project Presentation

⏰ Start Date: 31 October 2025

📞 For Registration & Details

📧Link in the first Comment
📱 Contact: 01714245384
🏫 Venue: Online ¦ ZOOM

26/04/2025

24/04/2025

Molecular Dynamics (MD simulation)
First class.

20/04/2025

মানুষের রোগপ্রতিরোধ ব্যবস্থা

----- রাফিদ নাহিয়ান রুবাইয়াত

অসংখ্য শহর, হরেক রকমের মানুষের সমন্বয়ের যেন গড়ে উঠে একটি রাষ্ট্র। সেই রাষ্ট্রকে প্রতি মুহূর্তেই অসংখ্য প্রতিক....

20/04/2025

Gene🧬 of the Week 1: p53
Name: p53
Location: Chromosome 17

p53 প্রোটিন মূলত টিউমার দমনকারী। এটি কোষ বিভাজন, ডিএনএ মেরামত এবং এপোপটোসিস (প্রোগ্রাম সেল ডেথ) নিয়ন্ত্রণ করে। এটি একটি ট্রান্সক্রিপশন ফেক্টর যা অন্যান্য জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে।
🔬এর কাজগুলো হলো:
কোষচক্র থামানো,
ডিএনএ মেরামত,
এপোপটোসিস,
টিউমার দমন,
অন্যান্য জিনের নিয়ন্ত্রণ।
💉Tp53 জিনে মিউটেশনগুলো ৫০% মানুষের ক্যান্সারে পাওয়া যায়। যা একে ক্যান্সার গবেষণায় সবচেয়ে অধ্যয়ন করা জিনগুলোর একটি করে তোলে।

11/02/2025

🚀 Unlock Your Career in Bioinformatics & Computational Biology with Our Internship! 🚀

Are you passionate about bioinformatics, computational biology, and data-driven research? Join our Project-Centric Internship and gain hands-on experience in real-world bioinformatics research projects!

🌟 What You'll Gain:
✅ Learn advanced bioinformatics tools
✅ Work on cutting-edge research projects
✅ Get certified and have the opportunity to publish your research
✅ Scholarships & fee waivers for top performers!

🎯 Who Can Apply?
🔹 Students: Bachelor’s & Master’s students in Biochemistry, Biotechnology, Microbiology, Botany, Zoology, Medicine, Nutrition
🔹 Professionals: Researchers, scientists, and faculty members in related fields

📅 Internship Duration: 2 to 6 months
💡 Limited Seats Available - Apply Now!

📌 Application Deadlines:

⏰February 28 (Notification by March 15)
⏰June 30 (Notification by July 15)
⏰November 30 (Notification by December 15)

💥 Get started on your bioinformatics journey today! 💥

👉 https://omicsbd.com/Project-Centric-Internship-in-Bioinformatics-and-Computational-Biology for Detail and Application

>>>>>
🚀 বায়োইনফরমেটিক্স এবং কম্পিউটেশনাল বায়োলজি ইন্টার্নশিপের মাধ্যমে আপনার ক্যারিয়ার শুরু করুন! 🚀

আপনি কি বায়োইনফরমেটিক্স, কম্পিউটেশনাল বায়োলজি, এবং ডেটা-ভিত্তিক গবেষণা নিয়ে আগ্রহী? আমাদের Project-Centric Internship-এ যোগ দিন এবং বাস্তব গবেষণা প্রকল্পে কাজ করে হ্যান্ডস-অন অভিজ্ঞতা অর্জন করুন!

🌟 আপনি কী লাভ করবেন:
✅ অ্যাডভান্সড বায়োইনফরমেটিক্স টুলস শেখার সুযোগ
✅ কাটিং-এজ রিসার্চ প্রকল্পে কাজ করার অভিজ্ঞতা
✅ সার্টিফিকেট এবং গবেষণা প্রকাশনার সুযোগ
✅ শীর্ষ পারফর্মারদের জন্য স্কলারশিপ ও ফি মওকুফ সুবিধা!

🎯 কে আবেদন করতে পারবে?
🔹 শিক্ষার্থীরা: বায়োকেমিস্ট্রি, বায়োটেকনোলজি, মাইক্রোবায়োলজি, বোটানি, জুলজি, মেডিসিন, নিউট্রিশন বিষয়ে ব্যাচেলর ও মাস্টার্স শিক্ষার্থীরা
🔹 পেশাজীবীরা: গবেষক, বিজ্ঞানী, এবং বিশ্ববিদ্যালয়ের শিক্ষকগণ

📅 ইন্টার্নশিপের সময়কাল: ২ থেকে ৬ মাস
💡 সীমিত আসন, এখনই আবেদন করুন!

📌 আবেদনের সময়সীমা:

⏰ফেব্রুয়ারি 28 (নোটিফিকেশন ১৫ মার্চ)
⏰জুন ৩০ (নোটিফিকেশন ১৫ জুলাই)
⏰নভেম্বর ৩০ (নোটিফিকেশন ১৫ ডিসেম্বর)

💥 আজই বায়োইনফরমেটিক্স ক্যারিয়ারে পদক্ষেপ নিন! 💥

👉 https://omicsbd.com/Project-Centric-Internship-in-Bioinformatics-and-Computational-Biology

04/02/2025

🚀 Master Molecular Dynamics Simulation with GROMACS! 🔬
Are you ready to dive into the world of Molecular Dynamics (MD) Simulation? Learn how to analyze biomolecular interactions using GROMACS, a powerful tool for computational research!

🔥 What You’ll Learn:
✅ Basics of MD Simulation
✅ System Preparation & Parameterization
✅ Running & Analyzing Simulations
✅ Hands-on Training with Real-World Applications

🎯 Perfect for: Researchers, Students, and Professionals in Bioinformatics, Computational Biology, and Drug Discovery!

📅 Enroll Now: 👉 https://omicsbd.com/courses/Molecular-Dynamics-Simulation:-GROMACS

🔗 Limited Seats Available! Don’t miss this opportunity to boost your research skills.



🚀 মলিকিউলার ডাইনামিক্স সিমুলেশন শিখুন GROMACS দিয়ে! 🔬
আপনি কি Molecular Dynamics (MD) Simulation শিখতে চান? এখনই যোগ দিন আমাদের GROMACS কোর্সে, যেখানে আপনি বায়োমলিকুলার ইন্টারঅ্যাকশন বিশ্লেষণ শিখবেন!

🔥 কোর্সের বিশেষ বৈশিষ্ট্য:
✅ MD Simulation এর বেসিক কনসেপ্ট
✅ সিস্টেম প্রস্তুতি ও প্যারামিটার সেটিং
✅ সিমুলেশন পরিচালনা ও বিশ্লেষণ
✅ বাস্তব জীবনের গবেষণায় প্রয়োগ

🎯 কার জন্য উপযুক্ত?
Bioinformatics, Computational Biology, ও Drug Discovery-এর শিক্ষার্থী ও গবেষকদের জন্য পারফেক্ট কোর্স!

📅 এখনই এনরোল করুন: 👉 https://omicsbd.com/courses/Molecular-Dynamics-Simulation:-GROMACS

🔗 সীমিত সিট! গবেষণায় দক্ষতা বাড়াতে সুযোগ হাতছাড়া করবেন না।