BIG: IMB BioInformatics Group / ՄԿԻ Կենսաինֆորմատիկայի խումբ

Շաբաթը ավարտենք լավ լուրով։ Հրապարակվեց մեր գիտական հետազոտությունը՝ նվիրված տիեզերական առաքելությունների ազդեցությանը մարդու առողջության վրա։ Այս հոդվածը արդյունք է մի շարք գիտական խմբերի տարիների համագործակցային աշխատանքի։ Մեր խումբը պատասխանու էր տվյալների կենսաինֆորմատիկական վերլուծության համար։ Մեզ հաջողվել է բացահայտել տիեզերական թռիչքի ազդեցությունը մարդու արյան մեջ շրջանառող փոքր ՌՆԹ մոլեկուլների քանակական կազմի վրա, ինչը կարող է հանդիսանալ կենսամարկեր տիեզերագնացների առողջական վիճակը գնահատելու համար։

Space flight associated changes in astronauts’ plasma‐derived small extracellular vesicle microRNA: Biomarker identification Click on the article title to read more.

Help to create genome bioinformatics computing infrastructure for Armenia

Genome Bioinformatics Computing Infrastructure for Armenia Powering the future of innovation & health for Armenia

We got published!
Check out our study on the projection of high-dimensional genome-wide expression on SOM transcriptome landscapes
https://www.mdpi.com/2673-7426/2/1/4

Our group participated in the study published in the Journal of the American Heart Association.
They investigated Blood samples of the 14 NASA astronauts who made a 5- to the 13-day mission to the International Space Station between 1998 and 2001. They found a significant increase in markers of inflammation, DNA damage and oxidative stress, which is a disruption in the balance of molecules that harm healthy tissue in the body and antioxidant defenses that neutralize them.
The paper have been mentioned in number of news publications (http://lnnk.in/fjbW)․

Մեր թիմը մասնակցել է հետազոտությանը, որը տպագրվել է Journal of the American Heart Association ամսագրում։
Նրանք ուսումնասիրել են NASA-ի 14 տիեզերագնացների արյան նմուշները, ովքեր 1998-2001 թվականներին 5-13 օր գտնվել են Միջազգային տիեզերակայան կայանում : Նրանք հայտնաբերել են բորբոքման, ԴՆԹ-ի վնասման և օքսիդատիվ սթրեսի մարկերների զգալի աճ, ինչը խախտում է մոլեկուլների հավասարակշռությունը, ինչը վնասում եմ մարմնի առողջ հյուսվածքը և հակաօքսիդանտ պաշտպանությունը։
Հետազոտությանը անրադարձել են մի շարք լրատվականներ (http://lnnk.in/fjbW)։
https://www.ahajournals.org/doi/full/10.1161/JAHA.121.022055

AHA News: Spaceflight Caused DNA to Leak Out of Astronauts' Cell Powerhouse US News is a recognized leader in college, grad school, hospital, mutual fund, and car rankings. Track elected officials, research health conditions, and find news you can use in politics, business, health, and education.

Ամփոփվել են «Ասպիրանտների և երիտասարդ հայցորդների հետազոտությունների աջակցության ծրագիր - 2021» մրցույթների արդյունքները: Շնորհավորում ենք մեր խմբի Siras Hakobyan-ին և Մելինե Հակոբյանին։ 🙂

scs.am

Անցյալ շաբաթ, շատ արդյունավետ էր մեր խմբի համար։ Երկու հեղինակավոր ամսագրերում միանգամից դուրս եկան հոդվածներ՝ նվիրված քաղցկեղների գենոմիկային`
«A Transcriptome-Wide Isoform Landscape of Melanocytic Nevi and Primary Melanomas Identifies Gene Isoforms Associated with Malignancy» հոդվածը տպագրվել է «International Journal of Molecular Sciences» (IF =5.9) ամսագրում:
«High-Resolution Cartography of the Transcriptome and Methylome Landscapes of Diffuse Gliomas» հոդվածը տպագրվել է Cancers (Basel) (IF = 6.6) ամսագրում։
Այս հետազոտությունների հիմքում ընկած է բազմամյա համագործակցությունը Hans Binder-ի հետազոտական խմբի հետ, որը հանդիսանում է Գերմանիայում գենոմային կենսաինֆորմատիկայի առաջնորդներից։
Երկու հոդվածում էլ կարևոր ներդրում է ունեցել Siras Hakobyan-ը, ով Maria Nikoghosyan-ի հետ միասին հանդիսանում են Հայաստանում սեքվենավորման տվյալների կենսաինֆորմատիկական վերլուծության եզակի մասնագետներից։ (Armenian Bioinformatics Institute) դպրոցի շրջանակներում Siras Hakobyan-ը նաև մասնակցում է գենոմային կենսաինֆորմատիկների նոր սերնդի պատրաստմանը։ Արդեն իսկ ակնհայտ է, որ սեքվենավորման վրա հիմնված գենոմային մեթոդների ներթափանցումը բժշկության ոլորտ Հայաստանում անխուսափելի է։ Ամբողջ աշխարհում բարդ քաղցկեղների դեպքում գենոմային հետազոտությունները դարձել են ստանդարտ, ինչպես նաև ձևավորվել է նոր մասնագիտություն՝ կլինիկական կենսաինֆորմատիկա, որը կարևոր նշանակություն ունի անհատականացված ախտորոշման և թերապիայի ընտրության համար։ Մեր նպատակն է Հայաստանում մարդկային ներուժի ձևավորմանը, որն ի վիճակի կլինի իրականացնել լայնամասշտաբ գենոմային ծրագրեր՝ փորձարարական, տվյալների վերլուծության և կլինիկական մեկնաբանության տեսանկյուններից։

Our group is performing bioinformatics analysis at the Science Exchange platform.
Check out our latest review 🙂
It is possible to perform high-quality bioinformatics work in Armenia.

We'd like to congratulate Arsen Arakelyan and Siras Hakobyan for receiving Yervant Terzian ANSEF 2021 award for their project on AI-based drug repositioning for COVID-19 with multimodal biological data. The main goal of the project is to develop a new drug repositioning method to effectively predict already FDA approved drugs for COVID-19 treatment.

Press Releases — ANSEF ANSEF competitions are typically announced at the end of May, with deadline around August 31. Competitions results are announced early January.

We got published!

✅ We have performed computational assessment of the mechanisms responsible for telomere maintenance in cancers and healthy tissues.

✅ Our approach uses literature-based reconstruction of pathway topologies, offers similar performance to experimental assays and is informative of the molecular triggers for pathway activation.

✅We find alternative lengthening of telomeres activity in healthy human te**is.

Full text: https://doi.org/10.3389/fgene.2021.662464

Lilit Nersisyan Arman Simonian Hans Binder Arsen Arakelyan

ԵՊԲՀ «Հերացի» ավագ դպրոցի աշակերտների աշխատանքը, որն իրականացվել է Կենսաինֆորմատիկայի խմբի օգնությամբ, ճանաչվել է լավագույն նախագիծ «Կենսաբանություն» անվանակարգում։ Աշխատանքը նվիրված էր Ալցհեյմերով հիվանդների գեների էքսպրեսիայի փոփոխության ուսումնասիրությանը։