Budynek został oddany do użytku 3 lutego 1959 roku. Od 3 września 1958 r. do 3 lutego 1959r. młodzież uczyła się na trzecią zmianę w dwóch szkołach – uczniowie klas I-IV w Szkole Podstawowej nr 2, natomiast młodzież klas V-VII w Szkole Podstawowej nr 6. Obowiązki kierownika szkoły pełniła wówczas Danuta Soja.
1 lutego 1959 roku Zdzisław Legut objął stanowisko kierownika szkoły. Jego zastępcą
została Danuta Soja. Z chwilą rozpoczęcia nauki do szkoły zapisanych było 673 uczniów. Takie były początki najtrudniejszego
w dziejach szkoły okresu. Baza materialna szkoły w pierwszych latach jej istnienia była stosunkowo uboga. Działalność na rzecz wyposażenia była prowadzona systematycznie. Obecnie szkoła posiada nowocześnie wyposażoną pracownię informatyczną dla klas starszych (sala 30) oraz nieco tylko skromniejszą dla klas I-III (sala 22). Gabinety języka polskiego (sala 6, 10, 34), matematyki (sala 33, 35), historii (sala 31), języka angielskiego (sala 32), przyrody (sala 9), muzyki (sala 21), religii (sala 36), nauczania zintegrowanego (sale 20, 22, 23, 24, 25), świetlicę (sala 7) i od roku 2008/2009 pomieszczenie dla oddziału sześciolatków (sala 8).
23 maja 1975 roku szkoła wzbogaciła się o boisko. Inicjatorem budowy była ówczesna dyrektor Rozalia Świdroń. Ponad 20 lat później, a więc w roku 2000 dzięki staraniom dyrektor szkoły Wandy Wołontowicz rozpoczęto budowę nowej hali gimnastycznej, której uroczyste otwarcie nastąpiło we wrześniu 2002 roku. Od roku szkolnego 2004/2005 szkoła wzbogaciła swoja ofertę edukacyjną o klasy o profilu baletowym. Inicjatorką ich utworzenia była dyrektor szkoły Wanda Wołontowicz. Funkcjonują one w oparciu o program autorskich klas baletowych opracowany przez Valerego Niekrasowa
i Wandę Wołontowicz (założycieli tych klas). W 1967 roku wystąpiono z wnioskiem o nadanie szkole imienia Mikołaja Kopernika. W 1969 roku w sali kina „Muza” odbyła się uroczystość nadania imienia szkole i wręczenia sztandaru ufundowanego przez Komitet Rodzicielski.
19 lutego 1973 roku odbyło się odsłonięcie tablicy pamiątkowej, którą umieszczono w holu szkoły z napisem „Mikołajowi Kopernikowi – wielkiemu polskiemu uczonemu w 500-lecie urodzin. Uczniowie. Rodzice. Nauczyciele.”
Płaskorzeźbę przedstawiającą Mikołaja Kopernika wykonał znany koszaliński rzeźbiarz Zygmunt Wujek. Symbolem Szkoły Podstawowej nr 9 stał się hymn, który powstał w latach siedemdziesiątych, autorką słów była nauczycielka muzyki Krystyna Złotopolska, muzykę skomponował Jan Kowalczyk. FUNKCJE DYREKTORÓW pełniło 6 osób: Danuta Soja, Zdzisław Legut, Rozalia Świdroń, Jadwiga Starkowska, Jan Lewandowicz i Wanda Wołontowicz.
Łącznie na przestrzeni minionego 50-lecia pracowało w szkole 258 nauczycieli. Nasza placówka wciąż pięknieje, rozwija się, a uczniowie czują się w niej bezpiecznie. W szkole stale poprawiamy warunki do nauki, dbamy o jej doposażenie. Uczniowie czują się w niej bezpiecznie. Cieszy się w środowisku dobrą opinią, może liczyć na pomoc sympatyków i przyjaciół
