Lokasi sekolah di kawasan luar bandar, 20KM dari Pejabat pelajaran Pekan Keningau dan 120 KM dari Jabatan Pelajaran Bandaraya Kota Kinabalu. Undan kepada Kerajaan British. Kedudukan sekolah pada mulanya ditempatkan di Pekan Apin-Apin. Namun demikian, semasa meletusnya peperangan dunia ke-2, yakni pada tahun 1943, sekolah itu dipindahkan ke Kampung Semangkuk Apin-Apin untuk menjamin keselamatan. Ke
adaan sekolah pada masa itu daif dan menyedihkan. Dindingnya diperbuat daripada bambu beratapkan daun rumbia dengan berlantaikan tanah serta tidak mempunyai meja dan bangku. Buku dan pensel murid diperbuat daripada batu. Oleh kerana kedudukan Kg. Semangkuk tidak strategik, maka Datuk Anthony kemudiannya mendesak pihak British agar sekolah itu dipindahkan semula ke Pekan Apin-Apin . Pembinaan bangunan SK. Apin-Apin dibuat secara gotong-royong dengan kerjasama penduduk sekitar SK. Apin-Apin seperti Kg. Ritting, Kg. Takad, Kg. Nuntunan, Kg. Ranggum dan Kg. Semangkuk. Selain daripada itu murid-murid sekitar Apin-Apin ada catatan yang menyatakan pelajar sekolah pada ketika itu datangnya dari sekitar Liau dan Bingkor, satu jarak yang agak jauh jika diukur dengan kemudahan perhubungan yang ada pada masa itu. Apin-Apin telah diasaskan oleh seorang anak watan berbangsa dusun. Beliau yang dimaksudkan ialah Datuk Anthony A. Undan. Beliau merupakan
Antara anak watan yang mula-mula meneroka dan membuka Kampung Apin-Apin
yang pada mulanya merupakan sebuah perkampungan yang kecil dan tidak ramai
penghuni, lama-kelamaan menjadi sebuah perkampungan yang besar dengan
kehadiran penduduk-penduduk dari kampung asal. Keadaan muka buminya yang
rata, berdekatan dengan sungai dan mempunyai tanah yang subur menjadi faktor
utama yang menyebabkan ramai masyarakat kadazandusun menempati tempat ini. Oleh kerana ramai kanak-kanak dilahirkan dan membesar tanpa pendidikan formal di Pekan Apin-Apin, Datuk Anthony A. Undan yang menyedari pentingnya pendidikan kepada generasi muda merayu dan mendesak kepada Kerajaan British agar dapat
membina sebuah sekolah rendah pada tahun 1942. Pelajar-pelajar yang ada pada masa itu kebanyakkannya datang dari sekitar Apin-Apin.