Mokykloje dirbo du mokytojai: mokyklos direktorius Seif Aksanov ir mokytoja Marijana Aksanova. Čia buvo dėstoma aritmetika, lietuvių kalba, rusų kalba, literatūrinis skaitymas, geografija, gamta, kūno kultūra, darbai, dainavimas. 1948-1949 metais mokykloje mokėsi jau 80 mokinių.
1951 metais buvo atidarytos pradinės klasės lenkų dėstomąja kalba.
1953 metais mokykla tapo septynmetė. Nuo 1963 metų ji jau aštuonmetė, kurioje mokėsi 176 mokiniai.
1965 metais mokykla persikėlė į naują dviejų aukštų pastatą.
1969-1970 mokslo metais Nemėžio mokykla tampa vidurine. Čia mokosi jau 412 mokinių.
1983 metais buvo pastatytas naujas mūrinis trijų aukštų mokyklos pastatas su erdviomis klasėmis, aktų ir sporto salėmis, valgykla, biblioteka. Prie mokyklos buvo įrengtas puikus stadionas.
1985 metais buvo atidaryta pirmoji lietuviška klasė. Klasėje buvo devyni mokiniai.
2009-02-23 – 2009-03-06 Nemėžio šv. Rapolo Kalinausko vidurinėje mokykloje vyko vadovų atestaciją II kvalifikacinei kategorijai. 2009-03-26 Vilniaus r. vadovų atestacijos komisija suteikė II vadybinę kategoriją:
Mokyklos direktoriui Zbigniev Maciejevskiui
Direktoriaus pavaduotojoms ugdymui: Onai Bevainienei, Valentinai Peršinai. Rapolo Kalinausko gimnazija nuo 2010 – 09 – 01 turi du skyrius:
Grigaičių pradinio ugdymo skyrius, Vilniaus rajono Savivaldybės tarybos sprendimas
„ Dėl kai kurių Vilniaus rajono švietimo įstaigų reorganizavimo ir vidaus struktūros pertvarkymo“ 2010 m. birželio 23 d. T3-207;
Vėliučionių pradinio ugdymo skyrius, Vilniaus rajono Savivaldybės tarybos sprendimas „Dėl Vilniaus r. Airėnų ir Vėliučionių pagrindinių mokyklų reorganizavimo ir Vilniaus r. Maišiagalos Kun.Juzefo Obrembskio, Maišiagalos Lietuvių Didžiojo Kunigaikščio Algirdo vidurinių mokyklų ir Vilniaus r. Rapolo Kalinausko gimnazijos vidaus struktūros pertvarkymo“ 2010 m. liepos 30 d. T3-229.
2011 – 2012 m. gimnazijoje yra 39 klasių komplektų:
Nemėžyje yra 31 klasių komplektų, juose mokosi 578 mokiniai:
18 klasių lietuvių dėstomąja kalba, mokosi 360 mokinių;
13 klasių lenkų dėstomąja kalba, mokosi 218 mokinių. Grigaičių pradinio ugdymo skyriuje yra 5 klasių komplektai,
juose mokosi 43 mokiniai:
3 klasės lenkų dėstomąja kalba, mokosi 25 mokiniai;
2 klasės rusų dėstomąja kalba, mokosi 18 mokinių. Vėliučionių pradinio ugdymo skyriuje yra 3 klasių komplektai,
juose mokosi 17 mokiniai:
2 klasės lietuvių dėstomąja kalba, mokosi 11 mokinių;
1 klasė lenkų dėstomąja kalba, mokosi 6 mokiniai. Rapolo Kalinausko gimnazijoje dirbantys pedagogai turi kvalifikaciją:
1 mokytoja ekspertė, 12 mokytojų metodininkų, 55 vyresnieji mokytojai, 1 spec. pedagogas, 1 soc. pedagogas, 1 logopedas, 1 psichologas, 27 atestuotų mokytojų. Iš viso dirba 99 pedagogai. Gimnazijoje taikoma kabinetų sistema. Yra du informacinių technologijų kabinetai, biologijos, chemijos, fizikos, geografijos, istorijos, lietuvių kalbos, tikybos, rusų kalbos, anglų kalbos, lenkų kalbos kabinetai, sporto salė, aerobikos salė, biblioteka, skaitykla.
