Laboratoire Microbiologie Santé et Environnement - LMSE

29/11/2022

مبارك لمختبر الميكروبيولوجيا الصحة والبيئة LMSE في الجامعة اللبنانية نشر مقال جديد حول بكتيريا Acinetobacter baumannii في مجلة FEMS Microbes، وهي مجلة جديدة محكّمة تابعة للمجلات العريقة FEMS وأكاديمية Oxford.
وهذه البكتيريا معروفة بمقاومتها للمضادات الحيوية، مما دفع منظمة الصحة العالمية الى تصنيفها من ضمن مسببات الأمراض ذات الأولوية للبحث والتطوير لإيجاد مضادات حيوية جديدة.
وقامت الدكتورة ريان الرافعي مع مجموعة من الزملاء في مختبر LMSE وبالتعاون مع باحثين من المعهد الأوسترالي لعلم الأحياء الدقيقة والعدوى وجامعة University of technology Sydney بتحليل الجينوم الكامل للعزلة المقاومة للمضادات الحيوية من Acinetobacter baumannii من مريض لبناني. ثم تخصصت الدراسة في دراسة بلازميد هذه العزلة، وهو DNA دائري صغير يحمل جينات مختلفة منها جينات المقاومة للمضادات الحيوية. وتكمن أهمية هذا البلازميد بإمكانية انتقاله بين البكتيريا وبالتالي نشر المقاومة على المضادات الحيوية. ولم تقتصر هذه الدراسة على تحليل هذا البلازميد فقط، بل أيضا على اثبات وجود العديد من البلازميدات في نوع Acinetobacter على قرابة بهذا البلازميد وتوصيف العديد من الجينات الموجودة فيهم التي لها علاقة بمقاومة البكتيريا للفيروسات BREX system، ب uric acid metabolism، وايضا بال phosphonate metabolism.

05/11/2022

ورشات تدريبية لكيفية أخذ عينات المياه والتأكد من خلوها من الجراثيم

نظم مختبر ميكروبيولوجيا الصحة والبيئة في الجامعة اللبنانية، ظهر اليوم، ورشة تدريبية لمتطوعي الصليب الاحمر اللبناني في المركز الرقمي الفرنكوفوني الموجود في المعهد العالي للدكتوراه في العلوم والتكنولوجيا في الجامعة اللبنانية في طرابلس.

كما نظم المختبر ورشة مماثلة للمراقبين الصحيين في بلديتي طرابلس والميناء.

وعرض رئيس المختبر الدكتور منذر حمزة في هذه الورش لخطورة المياه الملوثة جرثوميا على الصحة العامة ولأهم الامراض التي يمكن أن تنقلها المياه الملوثة بمياه المجارير.

ثم شرح بإسهاب مبدأ التحاليل التي تتم لتحديد وجود التلوث البرازي والدالات التي تتطلبها المواصفات لتحديد إن كانت المياه صالحة للشرب او لا.

ثم كان شرح مفصل للخطوات الواجب احترامها عند اخذ العينة حسب الاصول العلمية وكيفية تعريفها ونقلها بطريقة صحيحة الى المختبر.

وفي الختام، دار نقاش ساهم بترسيخ المعلومات التي وردت.

المصدر: الوكالة الوطنية للاعلام

02/11/2022

22/10/2022

زار وزير الصحة في حكومة تصريف الاعمال الدكتور فراس الابيض مختبر ميكروبيولوجيا الصحة والبيئة في الجامعة اللبنانية بطرابلس، يرافقه ممثل منظمة الصحة العالمية في لبنان عبد الناصر أبو بكر، نائبة ممثل "اليونيسف" في لبنان ايتي هيجنير، وفد من مفوضية شؤون اللاجئين في لبنان برئاسة يولي كيمشي، رئيس دائرة المستشفيات والمستوصفات في وزارة الصحة الدكتور هشام فواز، مدير المستشفى الحكومي بطرابلس ناصر عدره، رئيس مصلحة الصحة في الشمال الدكتور سعد الله صابونة، ورئيس مصلحة مياه لبنان الشمالي الدكتور خالد عبيد.

وكان في اسقبال الوزير الابيض والوفد المرافق عميد المعهد العالي للدكتوراه في العلوم والتكنولوجيا الدكتور نزيه المبيض ورئيس المختبر الدكتور منذر حمزة والاساتذة الباحثون والفنيون والموظفون.

وإطلع وزير الصحة ميدانيا على الوضع الوبائي والإجراءات المتخذة للاستجابة لتفشي "الكوليرا" وتقييم الوضع وتحديد الاحتياجات. ثم قام بجولة ميدانية في اقسام المختبر اعقبها اجتماع عمل أبدى خلاله وزير الصحة اعجابه بامكانات المختبر الفنية والبشرية واثنى على الدور الكبير الذي قام به المختبر خلال جائحة كورونا، "حيث كان منخرطا بقوة في اجراء التحاليل للوزارة".

ثم عرض الوزير الابيض الواقع الوبائي للكوليرا والإجراءات التي اتخذتها الوزارة لمواجهة تفشي المرض، وأكد "ضرورة استمرار التعاون العلمي والبحثي القائم بين الوزارة والمختبر، وبالتالي سيكون للمختبر دور اساسي في خطة المواجهة للكوليرا".

وشكر الدكتور حمزة للوزير الابيض والوفد المرافق زيارتهم، وأكد "متانة العلاقة بين المختبر والوزارة"، كما اكد "جهوزية المختبر التامة للاستجابة لاي طلب، سواء لتشخيص المرض بأحدث الطرق والتقنيات المتوافرة وأيضا لإجراء تحاليل المياه".

21/10/2022

https://www.aljazeera.net/news/science/2022/10/21/%d8%ad%d8%b1%d9%83%d8%a9-%d8%a8%d9%84%d8%a7-%d8%af%d9%85%d8%a7%d8%ba-%d8%a7%d9%83%d8%aa%d8%b4%d8%a7%d9%81-%d8%ad%d8%a7%d8%b3%d8%a8-%d8%a2%d9%84%d9%8a-%d8%af%d8%a7%d8%ae%d9%84%d9%8a

تمكن باحثون من رصد حركة معقدة لكائنات مجهرية أحادية الخلية، ربما تملك برمجة داخلية أشبه بحاسب آلي بدائي يمكّنها من المشي والتفاعل مع محيطها، بلا دماغ أو جهاز عصبي.

17/10/2022

زياره للدكتور عدنان البكري للمختبر.

زار صباح اليوم الدكتور عدنان البكري المختبر برفقه والده السيد معن البكري والدكتور احمد العلمي.
كان في استقبالهم رئيس المختبر الدكتور منذر حمزه .
عرض الدكتور حمزه لتاريخ نشأه المختبر ولنشاطه العلمي خلال السنوات المنصرمه ولنتاجه في المجال البحثي وللتحديات التي تواجهه اليوم بسبب الازمات التي غرق فيها لبنان والتي اثرت بشكل كبير على الجامعه اللبنانيه وعلى كافه العمل البحثي فيها.
ثم كانت زياره للمختبر شرح خلالها د حمزه الامكانات المتوفره والحاجيات الضروريه التي تؤمن استمرار العمل ولو بالحد الادنى.
ابدى د عدنان اعجابه بنشاط المختبر وأثنى على جهود الاساتذه الباحثين والمدربين الذين كان لهم دورا رياديا بجعل المختبر ذا سمعه علميه عالميه معتبره؛ وتأسف لقله الامكانات المتاحه حاليا وأكد حرصه على مسانده المختبر والسعي لدعمه .
في الختام اهدى د عدنان للدكتور حمزه نسخه من كتابه حول توقع حصول السرطان باستخدام الذكاء الاصطناعي ؛ كما أهداه د أحمد العلمي نسخا من منشورات لقاء الأحد الثقافي.في الختام اهدى د حمزه الدكتور عدنان البكري نسخه من كتابه عن المضادات الحيويه.

05/10/2022

ورشة عمل في طرابلس عن الكوليرا حمزة: مع الأسف احتمال وصولها إلينا كبير

نظم مختبر ميكروبيولوجيا الصحة والبيئة التابع للمعهد العالي للدكتوراه في العلوم والتكنولوجيا وكلية الصحة العامة في الجامعة اللبنانية، في مركز "العزم للبيوتكنولوجيا" - طرابلس، ورشة عمل عن مرض الكوليرا، بمشاركة ممثلين لمستشفيات ومختبرات طرابلس والشمال من دكاترة وفنيين.

وتحدث رئيس المختبر البروفسور منذر حمزة فأشار إلى أن "المختبر يؤدي دوره وواجبه لأنه مختبر مرجعي تعتمده وزارة الصحة اللبنانية لتشخيص الأمراض الجرثومية المعوية والسل والبكتيريا"، شارحا "أسباب تنظيم هذه الدورة، التي ترتكز على مخاطر انتقال الكوليرا من سوريا إلى لبنان"، وقال: "إن احتمال وصولها إلينا كبير مع الأسف، وهناك حاجة إلى تدريب العاملين في المختبرات الطبية في مجال كيفية التعامل مع هذه البكتيريا".

وعرض "تاريخ المرض والخصائص التي تتميز بها بكتيريا الكوليرا والظروف التي تتحكم بحياتها في البيئه المائية، خصوصا البحرية وانتقالها إلى الإنسان الذي يشكل المصاب بها المصدر الرئيسي للعدوى في المجتمع"، وقال: "هذه البكتيريا متكيفة للعيش في أمعاء الإنسان".

وأوضح أن "السلالات المرضية مرتبطة بمقدرتها على إفراز سم يدخل إلى داخل خلايا الأمعاء مسببا إسهالا عنيفا يؤدي إلى الوفاة، إذا لم يحصل المريض على العناية الطبية اللازمة".

وشرح "كيفية أخذ العينات ونقلها، ثم زرعها، مرورا بتعريف البكتيريا وفحص الحساسية للمضادات الحيوية".

وأكد "جهوزية المختبر للمساعدة في التعريف الدقيق للسلالات المعزولة".

المصدر: الوكالة الوطنية للاعلام

27/07/2022

نشر مختبر ميكروبيولوجيا الصحة والبيئة التابع للمعهد العالي للدكتوراه في العلوم والتكنولوجيا وكليه الصحه العامه في الجامعة اللبنانية بحثا جديدا حول فيروس الكورونا في مجلة viruses المحكّمة عالميا ( impact factor 5.818).
قام هذا البحث بدراسة انواع السلالات المنتشرة في المراحل الاولى من تفشّي الكورونا في لبنان من تموز 2020 الى شباط 2021 وذلك عبر تحليل الجينوم الكامل (Whole genome sequencing) من 200 عزلة من فيروس كورونا أخذت من مرضى من مناطق مختلفة ومن مختلف الجنسيات المتواجدين في لبنان وأيضا من المسافرين القادمين عبر الحدود اللبنانية السورية شمالا. لقد قمنا بتحليل كل داتا السلالات اللبنانية الموجودة في الموقع العالمي GISAID.
أظهرت النتائج انتشار سلالة (B.1.398) مع 3 متغيرات (alpha, delta, omicron) كانت المهيمنة خلال أول سنتين من تفشّي الكورونا في لبنان. تعتبر سلالة (B.1.398) هي السلالة الأولى التي كانت مهيمنة في لبنان والتي كانت منتشرة أيضا في الدنمارك وبعض دول أخرى. وقد قمنا بدراسة مسارات انتشار هذه السلالة (B.1.398) والتي بّينت دور لبنان الحيوي في نشر هذه السلالة الى بلدان أخرى. وسلطّت الضوء أيضا على دور الدول في إمكانية نشر متغيّرات جديدة في العالم.
هذه الدراسة جزء من دراسة الدكتوراه المشتركة للطالبة دلال نور في الجامعة اللبنانية تحت إشراف د. منذر حمزة، د. ريان رافعي ود. بشار اسماعيل وفي جامعة مرسيليا في فرنسا تحت اشراف د. فيليب كولسون. وقد تمت هذه الدراسة أيضا عبر تعاون علمي مميّز مع الفريق البرازيلي (المختبر الوطني للحوسبة العلمية) تحت اشراف د. ِأنّا تيريزا فاسكونسيلوس. وقد تمت تقنية Whole genome sequencing في مختبر Virology في ليون، فرنسا تحت اشراف د. برينو لينا. وموّل هذا المشروع كل من الجامعة اللبنانيّة وال Fondation Mérieux .
هذه الدراسة هي ثمرة تعاون وثيق مع وزارة الصحة حيث تم اعتماد مختبرنا (مختبرميكروبيولوجيا الصحة والبيئة) من قبلها لإجراء تشخيص عدوى الكورونا في شمال لبنان.
ويود المختبر أن يشكر منظمة الصحة العالمية عبر تسهيل ارسال العينات الى مختبر Virology في ليون فرنسا (وهو المركز المرجع للفيروسات التنفسية) وأيضا كل من العاملين والموظفين في وزاة الصحة وكذلك لجنة COVID في شمال لبنان والبلديات والصليب الأحمر اللبناني وجمعية الاسعاف اللبنانية والعاملين في المستشفيات الحكومية المشاركة وكافة العاملين في الحملات الميدانية لتعاونهم في هذه الدراسة. وأخيرا يوجه المختبر أيضا تحية خاصة الى كل أفراد طاقمه المميز من أساتذة وفنيين لجهودهم الجبّارة خلال تفشي الكورونا في لبنان.
اليكم رابط المقال لتفاصيل أكثر عنه:
https://www.mdpi.com/1999-4915/14/8/1640

07/07/2022

بحث استثنائي وطالبه استثنائيه
ناقشت اليوم الطالبه ايمان ياسين بحث تخرجها لنيل رساله الدكتوراه التي كانت مشتركه بين مختبر ميكروبيولوجيا الصحه والبيئة التابع للمعهد العالي للدكتوراه في العلوم والتكنولوجيا وكليه الصحه العامه في الجامعه اللبنانيه وبين مختبر وحده البكتريا المعويه في معهد باستور في باريس وجامعه باريس ديكارت. اشرف من لبنان على هذا البحث كل من البروفيسور فؤآد دبوسي والدكتوره ريان رافعي ومن فرنسا البروفيسور فرنسوا كزفييه ڤيل.
عنوان البحث هو : "الكشف الدقيق عن بكتيريا الشيغيللا من خلال دراسة تسلسل الجينوم الكامل
ومرض الشيغيلات ، أو الزنطاريا ، هو مرض إسهالي شديد العدوى ولا يزال يمثل مشكلة صحية عامة كبيرة ، مما يؤدي إلى وفاة آلاف الأشخاص حول العالم كل عام ، وخاصة الأطفال. يعتمد الترصد المخبري لعدوى الشيغيلا على طرق تقليدية تم تطويرها في أواخر الأربعينيات. هذه الطرق شاقة، غير دقيقة، وتستغرق نسبيا وقتًا طويلاً.

هدفت هده الدراسة الى فهم افضل لهدة المجموعة من البكتيريا بهدف تعريفها بشكل دقيق باستخدام تسلسل الجينوم الكامل حيث تم دراسة اكثر من 4000 سلالة، وذلك بهدف تطوير طرق المراقبة الوبائية والتعريف المخبري الدقيق لعدوى الشيغيلا. وتم ابتكار وتطوير طريقة جديدة وسهلة الاستخدام وذات دقة عالية. اطلقنا عليها اسم cgMLST وبالتالي تعتبر ابتكار جديد على المستوى العالمي.

لقد تم تطبيق هذه الطريقة على مجموعة من سلالات الشيغيلا التي تم عزلها في بعض مستشفيات شمال لبنان وكانت النتائج المتحصل عليها ذات قيمة علمية عالية وممتازة. صدر عن هذا البحث منشور علمي تم نشره في مجلة Nature communications وهي من كبريات المجلات العلمية العالمية ذات عامل تثقيل 17 وهناك أيضا بحثين ارسلوا الى مجلات عالمية للتقييم.

أشادت اللجنه بالمستوى العالي للباحثه الشابه دكتوره إيمان ياسين وتوقعت لها مستقبل علمي باهر وتمنت لها التوفيق في عملها القادم حيث قبلت كباحثه في جامعه أوكسفورد في بريطانيا .
التهاني للدكتوره إيمان ولاساتذتها وللمختبرين وللجامعه اللبنانيه التي خرجت المميزين ولجامعة باريس ديكارت

07/07/2022

الآنسة ريم بياع من مختبر ميكروبيولوجيا الصحة والبيئة تناقش اطروحتها وتنال شهادة الدكتوراة وتهنئة اللجنة الفاحصة.

ناقشت الانسة ريم بياع اطروحتها المقدمة لنيل شهادة الدكتوراة وذلك يوم الثلاثاء 5 تموز والتي قدمت خلالها نتاج بحثها العلمي المتعلق بمقاربات متقدمة لتشخيص مرض السل الرئوي ومتابعة فعالية علاجه.

النتائج ادت الى تحديد فحوص مخبرية مناعية وجينية مبتكرة وواعدة وذلك بالاعتماد على عينات من دم المرضى بشكل يتيح سهولة في التشخيص ومتابعة العلاج. وقد تم نشر هذه النتائج ضمن ثلات مقالات بحثية في مجلات علمية عالمية مرموقة.

عينات الدراسة تم جمعها من مرضى السل من خمس بلدان مختلفة تضمنت لبنان، الباراغواي، مدغشقر، بنغلاديش و جورجيا، وأجريت من خلال عمل علمي مشترك ومميز ضمن شبكة غابريال العالمية التابعة لمؤسسة مرييه.

هذه الدراسة تمت في اطار دكتوراه Co - direction بين جامعة ليون في فرنسا حيث يشرف عليها كل من د. فلورانس أدير ود. جوناتان هوفمان ضمن القسم الطبي و العلمي لمؤسسة مرييه، والجامعة اللبنانية ضمن مختبر ميكروبيولوجيا الصحة والبيئة التابع للمعهد العالي للدكتوراه في العلوم والتكنولوجيا ولكلية الصحة العامة باشراف د. منذر حمزة و د. بشار اسماعيل.
المشروع تم محليا بالتعاون مع مكتب مؤسسة مرييه وممثلة المؤسسة في لبنان د. جوزيت نجار ومع البرنامج الوطني لمكافحة السل التابع لوزارة الصحة اللبنانية عبر مركزي التدرن الرئوي في طرابلس وعكار بالتعاون مع مديرة البرنامج الدكتورة هيام يعقوب د. وليد البابا و د. ياسر طعوم والطاقم الصحي المرافق. بالاضافة الى مساهمة فنية مقدّرة من تقنيّي المختبر في الجامعة اللبنانية الآنسة سارة عمرية و الأستاذ طه عبدو

مختبر ميكروبيولوجيا الصحة والبيئة يبارك مجددا لريم ويتمنى لها مستقبلا زاهرا... إلى الأمام

30/06/2022

إنجاز علمي جديد للجامعه اللبنانيه وجامعه ليل في فرنسا.

ناقشت السيدة سماح مشمشاني المزوَّق يوم أمس بحث تَخَرٌّجِها لنيل شهادة الدكتوراه، وكانت بعنوان
"La technologie des barrières utilisant des enzymes à pouvoir déstructurant et du carvacrol microencapsulés pour lutter contre les bioflms de bactéries pathogènes"
هذه الدكتوراه كانت مشتركة بين مختبر ميكروبيولوجيا الصحَّة والبيئة (LMSE) التابع للمعهد العالي للدكتوراه في العلوم والتكنولوجيا وكلية الصحة العامَّة في الجامعه اللبنانية ومختبر الINRAe
(Institut National de Recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement)
أشرف على هذه الدراسة من لبنان كل من البروفيسور منذر حمزة والدكتور خالد العمري ومن فرنسا البروفيسور نور الدين شهيب والدكتور آدم غرسلاوي.

تمحورت هذه الدراسة على استخدام تقنيات بيولوجية جديدة للتخلُّص من الأغشية البيولوجية (Biofilm) وبالتالي من البكتيريا الضارَّة و/أو المُمْرِضة في القطاعين الغذائي والإستشفائي.
حيث تمَّ استخدام جزيئات نانَوِيَة (Nanoparticules) كحامل لمُركَّب طبيعي مستخرج من زيوت نباتية وهي مادَّة الCarvacrol التي لها تأثير قاتل للبكتيريا. كما تمَّ إضافة أنزيمين هاضمين للبروتينات مع هذه المادة وهما الPepsine وال Trypsine.

النتائج المُتَحَصَّل عليها شكَّلت قفزة علمية رائدة في هذا المجال.
ونتج عن هذا البحث أربع مقالات علمية نُشِرَ بعضها في مجلاَّت علمية مُحَكَّمة والبعض الأخر أُرسِلَ للنشر.
نتائج هذا البحث وتطبيقاته البالغه الأهمية قد تُسجَّل كبراءة إختراع.

مبروك للدكتورة سماح التي نالت درجة الشرف مع تهنئة شفهية خاصَّة من لجنة التحكيم.
كما نبارك لأساتِذتها المشرفين وللمختبرين الLMSE والINRAe.