مأموريت سازماني:
1ـ ايجاد الگوي مناسب براي تغيير نگرش مديريت در آموزش بخش متوسطه.
2ـ تربيت دانشمندان و پژوهشگران آيندهي ايران اسلامي با سمت دهي انگيزهها و آموزشهاي عميق علوم پايه.
3ـ تعيين نگرش ديني و عرق ملي در بين دانشآموزان فرهيخته.
چشماندازها:
* كسب جايگاه اول علمي در عرصه داخلي و حضور برتر در المپيادهاي كشوري.
* نمايشگاهي دائم جهت بازديد مديران توسعه جو از سراسر كشور.
* سرمنشاء نوآوريهاي علمي و فرهنگي در سطح جهانی و کشوری در مقطع متوسطه.
* گردآوري برترين کادر آموزشی و دانشآموزان شهر تهران در راستای یک هدف
* توجه بيشتر به يادگيري بجاي ياددهي با روشهايي مانند «معلم پژوهنده» و «سازمان يادگيرنده».
* هم راستا سازي اهداف آموزشي و فرهنگي در قلب و ذهن دانشآموزان با استفاده از هم افقسازي نگاه دبيران، مربيان و مديران.
براساس همين اهداف و سياستها، مديريت و كادر دبيرستان انرژي اتمي اعتقاد پيدا كرد كه كسب مدارج علمي در راستاي دستيابي به اهداف مقدس جمهوري اسلامي ايران، بزرگترين جهاد علمي و جنبش نرمافزاري است كه مقام معظم رهبري همواره بر آن تأكيد داشتهاند.
دبيرستان انرژي اتمي دانشآموزان را ارزشمندترين سرمايه حال و آينده كشور دانسته و براي آنان حداكثر تلاش و كوشش مادي و معنوي را به كار بسته و با اعتقاد و به کارگیری فنآوري و تكنولوژي روز بستري مناسب و ساختاري جديد براي بهبود كيفيت آموزش فراهم آورده است.
توجه به درخواست مردم، اهميت دادن به استعدادهاي فردي دانشآموزان، ايجاد كار گروهي و افزايش روح سازماني در بين دبيران و كادر آموزشي دبيرستان، صداقت، شفافسازي، مردم داري و تلاش همراه با نوآوري از دستآوردهاي دبيرستان انرژي اتمي در 20 سال گذشته است.