Politeknik Mekatronika Sanata Dharma memiliki tiga program studi jenjang diploma III, yaitu: Mekatronika, Instrumentasi Medis, dan Desain Produk Mekatronika. SK Ijin pendirian politeknik terbit dan ditetapkan sejak tanggal 11 Agustus 2011, dengan SK No. 175/E/O/2011 yang disahkan oleh Mendiknas RI. Program D3 Mekatronika dibuka pertama kali pada tahun 1998 dengan SK Ditjen DIKTI No.149/DIKTI/Kep/
1998. Dua program studi lainnya adalah prodi baru bersamaan pengajuan ijinnya dengan pendirian Politeknik. Mekatronika sebagai sebuah profesionalisme berorientasi ke pasar modern. Pasar modern memiliki sifat: mengejar umur pakai produk yang singkat, tangguh berkompetisi dalam persaingan bebas, inovatif di dalam memenuhi permintaan konsumen yang bervariasi dan berbeda, dan mampu menggunakan setiap teknologi terbaru pada setiap produk terbarunya.
