Pondok Pesantren Al Aziziyah 3 terletak di kampung Sebaneh sekitar 3 km utara kabupaten Bangkalan Madura
Bermula pada hari Selasa 17 Jumada al-Ula 1425 H | 06 Juli 2004 seseorang dari kabupaten Sampang menitipkan anaknya,
KH. Raudhatul Mutaallimin Al Aziziyah 1 dan 2 Sebaneh Bancaran Bangkalan. Pada awalnya beliau yang sudah mengajar di Al Aziziyah 1 dan 2 sejak kepulangannya selepas mukim di Makkah hampir 7 tahun itu merasa kampung Sebaneh sudah tidak membutuhkan pesantren
namun, atas Isyarat sebagian Masyayikh di Makkah dan petunjuk guru guru beliau di PP. Tengghinah Tattangoh Proppo Pamekasan pesantren Al Aziziyah 3 inipun berdiri meski tanpa nama, Semua melarang beliau menolak santri yang akan dititipkan khusus kepada beliau. sampai akhirnya, beberapa tahun kemudian setelah banyak masyarakat mendengar Pengasuh Al Aziziyah 1 KH. Saiful Qohhar menyuruh agar pesantren ini di namai Al Aziziyah 3 demi keseragaman.
