Laboratorio de Bioquímica y Biología Molecular UChile

11/05/2024

Felicitamos a nuestro compañero, el Dr. Felipe González, que este jueves 9 de abril defendió su tesis doctoral, siendo evaluado con distinción máxima.

Su tesis se tituló "Análisis de la regulación alostérica en enzimas del metabolismo central de azúcares de archaea". Durante la realización de este trabajo realizó importantes descubrimientos sobre el funcionamiento de enzimas de Archaea, que han permitido abrir nuevas líneas de investigación en nuestro laboratorio. Además, es pionero en el uso y difusión de la criomicroscopía electrónica en nuestro país, una importante técnica en el estado del arte mundial de la biología estructural.

26/05/2023

Este mes nuestro laboratorio ha sido incorporado como miembro del Centro de Biología Estructural del Mercosur (CEBEM) (https://www.cebem-lat.org/), que agrupa la los grupos de investigación en biología estructural más importantes de nuestra región. Esto es un gran reconocimiento a nuestro trabajo y trayectoria; en palabras del profesor Víctor Castro, "así como antes los chilenos teníamos que ir otros laboratorios extranjeros donde existía la experiencia o la experticia en estas metodologías, ahora, el pertenecer a este centro, nos acredita para que otros estudiantes de la región, de Perú, de Paraguay, de Argentina, vengan a nuestro laboratorio a entrenarse. Nos reconocen como un laboratorio en el cual hay una experiencia y un conocimiento en Biología Estructural"

11/05/2023

Nueva publicación de nuestro laboratorio.

Clásicamente, se asume que las enzimas que fosforilan glucosa en mamíferos (y en eucariontes en general) utilizan ATP como dador de fosforilo. Sin embargo, se ha descubierto que existe una enzima que utiliza ADP en lugar de ATP para fosforilar glucosa, la que fue transferida ancestralmente a los eucariontes desde las Archaea. En este artículo reportamos la primera caracterización bioquímica detallada de la glucoquinasa ADP-dependiente de humanos, describiendo su mecanismo cinético y sus propiedades regulatorias. Además de eso, realizamos un análisis filogenético para estudiar su distribución entre los eucariontes y compararla con sus homólogos en Archaea.

En esta publicación participan como autores principales Alejandra Herrera y Gabriel Vallejos y fue publicado en la revista Archives of Biochemistry and Biophysics.

Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003986123001017?via%3Dihub

22/03/2023

Hoy felicitamos a Nicolás Fuentes Ugarte, que ha obtenido su grado de Magister en Biología con distinción máxima.

Su tesis consistió en la caracterización de los mecanismos evolutivos y las bases estructurales de la especificidad por sustrato en una familia de enzimas fosforilantes de vitaminas. Para esto empleó técnicas experimentales, como la cristalografía de rayos X de proteínas, como también herramientas de bioinformática y biofísica computacional.

Actualmente, Nicolás se encuentra comenzando su tesis de doctorado en nuestro laboratorio, donde continuará su investigación en el contexto de biología estructural y la evolución molecular de enzimas.

23/02/2023

Hoy queremos felicitar a Sebastián Muñoz, actualmente estudiante de doctorado de nuestro laboratorio, que este se ha adjudicado la Beca ANID de doctorado nacional. Junto con esto, al finalizar el año académico precedente obtuvo su grado de magister con distinción máxima.
Sebastián realizó su tesis de magister en el área de biología estructural integrando técnicas como cristalografía y criomicroscopía electrónica (Cryo-EM).

Su tesis se realizó en el marco de un proyecto de colaboración en conjunto con la Fundación Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (FUCITED) y la Universidad de São Paulo.

Cabe destacar que Sebastián es uno de los primeros en implementar la metodología Cryo-EM desde Chile, lo que convierte a su tesis en un punto de referencia para el desarrollo de la biología estructural en el país.

30/12/2022

Entre el 16 y el 27 de enero de 2023 estará en Chile el Dr. Roberto Fernández Lafuente, del Instituto de Catálisis y Petroleoquímica de Madrid, quien es considerado una autoridad a nivel mundial dentro del campo de la biocatálisis y la aplicación de enzimas a la industria.
Durante su estadía en Chile dictará dos cursos y otorgará dos conferencias.

Las postulaciones a los cursos estarán disponibles hasta el 10 de enero.

Curso 1:
Biocatálisis: Uso de enzimas en la Industria

Fecha: 17 al 20 de enero de 2023
Horarios: Mañana 8:30 hrs a 12:30 hrs; Tarde 14:30 hrs a 17:30 hrs

Postulaciones en el siguiente link: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeYipiZt4xL0uTG6_mWQg_D3IX7N8TJ4O8j-RwD6AR4z2xaTw/viewform

Curso 2:
Inmovilización avanzada de enzimas: métodos de inmovilización

Fecha: 23 al 27 de enero de 2023
Horarios: Mañana 8:30 hrs a 12:30 hrs; Tarde 14:30 hrs a 17:30 hrs

Postulaciones en el siguiente link: https://forms.gle/zM6w9ChTYBM2CJo57

Conferencias:

"Inmovilización de lipasas por activación interfacial: ventajas y problemas"
Miércoles 18 de enero de 2023 a las 12:00 hrs.

"Coinmovilizacion de enzimas: necesidad e inconvenientes"
Miércoles 25 de enero de 2023 a las 12:00 hrs.

Todas las actividades se llevarán a cabo en la Facultad de Ciencias de la Universidad de Chile.

15/12/2022

Durante el mes de diciembre, el profesor Víctor Castro y Felipe González (investigador doctoral del laboratorio) fueron seleccionados para asistir a a un workshop sobre criomicroscopía electrónica organizado por el Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM) de Brasil (https://pages.cnpem.br/cryo-em/).

Durante estos último dos años en nuestro laboratorio hemos comenzado a desarrollar esta técnica con la ayuda de nuestros colaboradores tanto de Brasil como de Alemania. Actualmente ya hay tesistas de postgrado que han incluido con gran éxito dicha técnica en sus trabajos, siendo Felipe González uno de ellos.

10/12/2022

Este semestre dos de nuestros alumnos de pregrado ganaron importantes becas internacionales para realizar pasantías en Brasil.

Ignacio Aravena, estudiante de Bioquímica de la Universidad de Chile, se adjudicó la Beca Jhoti, Cortés & Salazar otorgada por el Instituto de Física de São Carlos de la Universidade de São Paulo, que consiste en la realización de una pasantía de investigación en dicha institución. Gracias a esto, Ignacio trabajará por dos meses en el campo de la Criomicroscopía electrónica (Cryo-EM) en laboratorio del Dr. André LB Ambrosio.

Martín Pereira, estudiante de Ingeniería en Biotecnología Molecular de la Universidad de Chile, se adjudicó una beca del programa de Becas de Verano (PBV) otorgada por el Centro Nacional de Investigación en Energía y Materiales (CNPEM) de Brasil. En este programa cada estudiante se le otorga el desafío de desarrollar un plan de trabajo dentro de un proyecto de investigación interdisciplinario propuesto por investigadores del CNPEM.

Felicitamos a Ignacio y Martín por su reciente logro y les deseamos lo mejor en este nuevo desafío.

28/11/2022

La semana pasada, entre el 22 y el 25 de noviembre se realizó la XLV reunión anual de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile. En esta instancia nuestro laboratorio tuvo una destacada participación, contribuyendo con 5 presentaciones orales, 6 posters y un trabajo de incorporación.

Este año el premio a mejor presentación oral fue otorgado a Sebastián Muñoz, estudiante de doctorado de nuestro laboratorio; mientras que Nicolás Fuentes, también estudiante de doctorado, recibió una mención honrosa por su presentación. Por otro lado, Gabriel Vallejos, investigador postdoctoral del laboratorio, se incorporó este año a la SBBMCh.

Nuestro laboratorio, desde que se fundó hace más de 50 años, ha participado y promovido instancias donde se fomente e impulse la investigación en bioquímica y biología molecular en el país, siendo la Sociedad Chilena de Bioquímica y Biología molecular una de las más importantes, en la que nuestros miembros han tenido un papel fundamental desde su creación en 1974.

22/11/2022

Entre el 8 y el 11 de Noviembre de este año se realizaron las III Jornadas de Biocatálisis en conjunto con el IV Simposio Latinoamericano de Biocatálisis y Biotransformaciones, donde los miembros de nuestro laboratorio tuvieron una destacada participación. El Profesor Victor Castro fue parte del comité organizador. Nicolás Fuentes (estudiante de Doctorado) y Gabriel Vallejos (investigador postdoctoral) presentaron sus trabajos como parte de la sección de enzimología estructural, mientras que la profesora Victoria Guixé fue una de las conferencistas invitadas al evento.
Junto con esto, Claudia Mella, investigadora doctoral del laboratorio, recibió unos de los premios al mejor poster de la jornada.

28/10/2022

✅ ¡Te traemos este de que no te puedes perder! Aún estás a tiempo de inscribirte en la Universidad de Chile

👉El Doctorado en Ciencias mención Biología Molecular, Celular y Neurociencias, está enfocado directamente en las áreas de conocimiento de Ciencias Naturales y Matemáticas.

🧪Este programa es uno de los más antiguos de su tipo y de gran tradición en el país. Se caracteriza por entregar una sólida formación en diferentes aspectos básicos de la biología experimental.

🤓El fuerte énfasis en las disciplinas asociadas a la Biología Molecular, la Biología Celular y las Neurociencias, definen el nombre del Programa. El carácter del Programa es eminentemente -académico, ya que su finalidad es potenciar al máximo la formación de recursos humanos altamente calificados para fortalecer el sistema nacional e de investigación y aplicada.

🟢Consistentemente, el 96% de las/los graduadas/os de los últimos 10 años está realizando investigación en Universidades públicas o privadas.

¿Cuáles son los requisitos? 👇

👀Podrán postular al programa de Doctorado en Ciencias con mención en Biología Molecular, Celular y Neurociencias quienes estén en posesión del grado de o de Magister en Ciencias Biológicas o disciplinas afines, otorgados por universidades o que aseguren una formación satisfactoria para los fines del programa.

📌Detalles de admisión e inscripción: https://uchile.cl/u6270

05/09/2022

Interesante artículo sobre la filosofía de la bioquímica escrito por Gabriel Vallejos, investigador postdoctoral de nuestro laboratorio, publicado en la Revista Culturas Científicas de la USACH.

❗️❗️ ¡Revisa las extensiones de nuestras convocatorias y suscríbete a nuestro newsletter! [https://linktr.ee/culturascientificas].

🔸Título: Problemas contemporáneos en la filosofía de la bioquímica: lecciones desde el plegamiento de proteínas y el problema in-vitro/in-vivo

🔻Autor: Gabriel Vallejos-Baccelliere (Universidad de Chile)

🔹Abstract: Si bien en la filosofía de las ciencias ya se han explorado algunos ejemplos provenientes de la bioquímica como casos de estudio, la filosofía de la bioquímica (i.e. el estudio filosófico sistemático de los problemas metacientíficos de esta ciencia) es una subdisciplina naciente. En este artículo estudiaremos dos problemas filosóficos de relevancia contemporánea en esta ciencia. Por un lado, examinaremos las bases epistemológicas del problema del plegamiento de proteínas. En particular lo relacionado con la predicción de la estructura tridimensional de las proteínas a partir de su secuencia, asunto que ha dado mucho que hablar debido a los nuevos avances utilizando deep learning. Por otro lado, exploraremos el problema in-vitro/in-vivo y, más generalmente, el problema de la extrapolación en las ciencias biológicas. Finalmente, a partir de las consecuencias de ambos temas consideraremos algunas reflexiones filosóficas generales acerca del reduccionismo, el pluralismo y el lugar de la bioquímica en las ciencias biológicas.

🔹Palabras clave: Bioquímica, Plegamiento de proteínas, In-vitro/in-vivo, Pluralismo, Reduccionismo.