Em 1950 inicia-se a construção da primeira escola e capela da Igreja Católica Apostólica Romana, que funcionava no mesmo espaço, localizada onde é atualmente o salão multiuso. Trabalharam na construção: Alberto Paulus, Alsidio Geller, Alberto Grinke, Percival Leimer, João Cruz, Pedro Machado, Alfredo Manske, Adelino Corbeline, Rudi Tomas, Seno Werlang e Seu Giongo. A obra custou Cr$ 10.644,60 dez mil, (seiscentos e quarenta e quatro cruzeiros com sessenta centavos), e foi custeada pela Empresa do colonizador Sr. Nesta época a escola era multiseriada. Tempo depois a escola passou a ser administrada pelo município de São Carlos, quando recebeu o nome de Escola Isolada Municipal de Vila Modelo. No ano de 1957, é construído outro prédio para abrigar a escola, com dois andares e duas salas para cada pavimento. Em 1962, o Estado assumiu a manutenção e administração da escola e esta recebeu a denominação de Escolas Reunidas Dom Helder Câmara. A primeira diretora foi a Professora Tereza Muxfeldt. No ano de 1968 a escola passa a chamar-se Grupo Escolar Dom Helder Câmara. Até esse período era oferecido aos alunos o ensino primário de 1° a 5° ano. Em 1968 foi criado o Ginásio Normal João Muxfeldt, que funcionava no turno noturno e no espaço cedido pelo Grupo Escolar Dom Helder Câmara, onde os alunos poderiam cursar as quatro séries do ginásio, de 1ª a 4ª série ginasial (hoje se refere ao Ensino Fundamental de 5ª a 8ª série). Para a escola se manter eram feitas apresentações teatrais no Hotel do Sr. Osvaldo Schlösser, que cedia o espaço. Também eram feitos bailes. Não havia merenda e o Estado destinava poucos recursos para a Escola. No ano de 1969 foi inaugurado o prédio que atualmente está sendo utilizado. Em 08 de fevereiro de 1971, pelo decreto nº 10304, passam a compor a Escola Básica Dom Helder Câmara o Grupo Escolar Dom Helder Câmara e o Ginásio Normal João Muxfeldt,
Nos anos de 1973 a 1987, a Escola Básica Dom Helder Câmara cedeu seu espaço para que no turno noturno funcionasse o CNEC - Colégio Cenecista José de Alencar que oferecia o 2º Grau, hoje Ensino Médio. No ano de 1991, foi inaugurada a terceira ala. Em 1996, construído um pavimento para instalação de banheiros e ampliada a cozinha. Pelo Parecer nº- 33/96 de 22/02/96, foi autorizado o funcionamento do Curso de Ensino médio de Educação Geral, na Escola Básica Dom Helder Câmara, passando a denominar-se Colégio Estadual Dom Helder Câmara. No ano de 2004/2005, a escola passa por uma reforma e ampliação, com a construção de mais três salas de aula e um auditório, tornando-se o espaço que hoje é a Escola de Educação Básica Dom Helder Câmara. Em setembro de 2005, é instalado o Projeto Escola Aberta, criado pelo Governo Federal e mantido pelo estado, para atender a toda a população do município nos finais de semana, com atividades culturais, esportivas e de lazer. No ano de 2009, através de concurso entre os alunos, foi criado o logotipo da escola, que faz parte dos documentos oficiais, uniforme, bandeira e fachada da instituição.